More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2800 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 393 aa  812    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  46.91 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  45.92 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  45.36 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  45.6 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  45.82 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  46.08 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  45.82 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  43.3 
 
 		 391 aa  358  8e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  41.84 
 
 		 409 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  42.93 
 
 		 386 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  44.36 
 
 		 391 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  41.69 
 
 		 389 aa  346  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  41.46 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  41.45 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  41.25 
 
 		 383 aa  338  9e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  46.53 
 
 		 521 aa  337  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  40.99 
 
 		 383 aa  336  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  40.99 
 
 		 383 aa  335  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  40.99 
 
 		 383 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  40.99 
 
 		 383 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  40.99 
 
 		 383 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  40.58 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  40.21 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  40.87 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  40.73 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  40.73 
 
 		 383 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  41.65 
 
 		 401 aa  330  4e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  40.2 
 
 		 391 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  39.9 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  43.19 
 
 		 372 aa  317  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  39.85 
 
 		 398 aa  316  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  41.13 
 
 		 386 aa  312  6.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  38.28 
 
 		 383 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  40 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  41.13 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  39.69 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  41.37 
 
 		 383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  45.05 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  40.26 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  37.53 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  39.29 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  39.65 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  41.09 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  36.2 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  36.99 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  38.87 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  37.47 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  37.02 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  38.68 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  38.92 
 
 		 392 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  38.58 
 
 		 399 aa  285  7e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  38.78 
 
 		 379 aa  285  9e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  38.87 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  41.64 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  38.46 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  40.05 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  38.6 
 
 		 385 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  38.62 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  37.63 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  37.85 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  37.98 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  37.56 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  37.18 
 
 		 389 aa  279  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  39.13 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  37.95 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  39.59 
 
 		 399 aa  275  8e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  37.06 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  35.66 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  36.55 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  36.03 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  36.15 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  38.76 
 
 		 375 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  35.79 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  37.12 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  34.99 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  37.47 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  37.21 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  37.21 
 
 		 400 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1614  cystathionine beta-lyase  34.77 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  36.83 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  36.79 
 
 		 400 aa  255  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  36.91 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2960  aminotransferase, classes I and II  33.93 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  37.04 
 
 		 402 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  37.04 
 
 		 402 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  37.04 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  34.88 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  34.88 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  34.88 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  34.88 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  34.88 
 
 		 390 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>