More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0932 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  100 
 
 
387 aa  795    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  57.51 
 
 
392 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  56.74 
 
 
385 aa  441  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  56.23 
 
 
385 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  55.24 
 
 
383 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  53.87 
 
 
386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  51.82 
 
 
381 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  54.33 
 
 
376 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  48.71 
 
 
385 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  45.19 
 
 
383 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  46.13 
 
 
390 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  44.65 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  43.48 
 
 
390 aa  328  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  41.69 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  42.64 
 
 
391 aa  316  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  41.71 
 
 
395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  40.98 
 
 
391 aa  288  8e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 
401 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  43.12 
 
 
384 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  36.92 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  40.36 
 
 
394 aa  279  6e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  43.73 
 
 
386 aa  277  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  39.74 
 
 
386 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  37.18 
 
 
386 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  40.66 
 
 
393 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  35.11 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  35.11 
 
 
393 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  38.35 
 
 
396 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  34.86 
 
 
393 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  40.2 
 
 
405 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  36.62 
 
 
521 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  39.34 
 
 
392 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  36.91 
 
 
378 aa  262  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  34.03 
 
 
383 aa  262  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  40.15 
 
 
386 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  36.78 
 
 
395 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  39.09 
 
 
409 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  35.09 
 
 
391 aa  258  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  33.51 
 
 
383 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  33.51 
 
 
383 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  35.28 
 
 
372 aa  257  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  33.51 
 
 
383 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 
383 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  37.91 
 
 
412 aa  255  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  34.59 
 
 
397 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  33.25 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  33.25 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  40.31 
 
 
514 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  34.78 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  33.25 
 
 
383 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  38.58 
 
 
398 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  32.99 
 
 
383 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  32.99 
 
 
383 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  34.01 
 
 
389 aa  249  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  37.12 
 
 
393 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  32.73 
 
 
383 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 
397 aa  249  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 
393 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  33.93 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  35.44 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  37.92 
 
 
385 aa  242  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  37.92 
 
 
385 aa  242  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  34.95 
 
 
400 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  38.4 
 
 
391 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  36.46 
 
 
399 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  35.97 
 
 
390 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  35.97 
 
 
390 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  35.13 
 
 
387 aa  237  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  34.77 
 
 
390 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  35.71 
 
 
390 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  38.89 
 
 
390 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  40.05 
 
 
414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 
386 aa  236  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  32.49 
 
 
404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  33.75 
 
 
396 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  33.5 
 
 
394 aa  230  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28388  predicted protein  39.19 
 
 
389 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0426806  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  36.51 
 
 
391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  31.41 
 
 
397 aa  226  6e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  34.53 
 
 
390 aa  226  7e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  32.56 
 
 
389 aa  225  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  32.13 
 
 
383 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  35.2 
 
 
394 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
390 aa  222  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  35.03 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  34.94 
 
 
390 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  32.56 
 
 
399 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  32.91 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  32.39 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  31.85 
 
 
387 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  35.14 
 
 
400 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  33.42 
 
 
392 aa  209  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
392 aa  209  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
392 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1347  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 
381 aa  206  5e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  32.9 
 
 
390 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  34.69 
 
 
389 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  33.74 
 
 
402 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  33.67 
 
 
400 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  34.22 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>