More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4578 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 386 aa  764    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  40.99 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  44.74 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  40.69 
 
 		 385 aa  209  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  37.29 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  37.57 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  40.35 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  34.38 
 
 		 514 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  38.61 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  36.22 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  33.51 
 
 		 417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  37.83 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  38.96 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  36.67 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  38.79 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  41.77 
 
 		 415 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  31.77 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  40.58 
 
 		 383 aa  189  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  31.88 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2509  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  34.48 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  35.23 
 
 		 387 aa  185  9e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  37.12 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  28.84 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  35.18 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  32.14 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  29.25 
 
 		 390 aa  182  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  36.1 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  33.7 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3079  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171547  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  37.6 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  35 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  31.9 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  25.88 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  28.45 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  25.61 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  25.88 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  25.61 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  25.61 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  31.71 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  31.15 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  24.93 
 
 		 383 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 		 384 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  24.93 
 
 		 383 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  32.11 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  25.34 
 
 		 383 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  25.34 
 
 		 383 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  30.27 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  30.82 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  30.82 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 		 390 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  32.78 
 
 		 393 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  32.25 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  29.14 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  32.62 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  31.66 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  35.25 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  35.25 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  38.57 
 
 		 381 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  28.76 
 
 		 412 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 		 386 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  31.11 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  29.62 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  36.96 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  29.43 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  24.33 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  30.43 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  28.81 
 
 		 521 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  32.53 
 
 		 409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  28.76 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  34.41 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  32.15 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  25.53 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  29.29 
 
 		 390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  29.81 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 		 396 aa  163  6e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  31.96 
 
 		 390 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  31.68 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  31.58 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  31.02 
 
 		 394 aa  161  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  31.87 
 
 		 392 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  31.87 
 
 		 392 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  31.41 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  31.3 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  28.11 
 
 		 391 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  28.65 
 
 		 391 aa  160  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  31.3 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  28.39 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  31.3 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  32.37 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  30.35 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  35.16 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  30.35 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  31.52 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  30.35 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  31.02 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>