More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3079 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3079  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 394 aa  776    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171547  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  43.6 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  47.14 
 
 		 386 aa  292  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  39.02 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  46.07 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  37.92 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  37.17 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  36.01 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  31.96 
 
 		 514 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  38.38 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  34.2 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  31.11 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 		 386 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  32.23 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  32.91 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  35.38 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  30.83 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  31.45 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  29.55 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  33.86 
 
 		 381 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  29.53 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  34.17 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  37.47 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  29.72 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 370 aa  155  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  34.62 
 
 		 393 aa  156  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  29.68 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  30.83 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  29.23 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  29.84 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  30.29 
 
 		 395 aa  154  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  29.9 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  26.92 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  31.11 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  29.15 
 
 		 392 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  33.7 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  28.28 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  34.08 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  26.33 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  30.4 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  32.49 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  30.33 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  31.37 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  27.39 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  28.76 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  32.12 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  35.13 
 
 		 384 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  26.8 
 
 		 404 aa  142  7e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  26.58 
 
 		 389 aa  143  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2509  aminotransferase class I and II  32.41 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  27.97 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  30.49 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  31.11 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  30.49 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  30.49 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  27.37 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  27.08 
 
 		 386 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  26.51 
 
 		 383 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  27.11 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  30.62 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  30.31 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  30.26 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  26.84 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  26.51 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  28.49 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  31.88 
 
 		 386 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  27.49 
 
 		 391 aa  135  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  24.48 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  25.86 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  25.59 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  27.35 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  25.59 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  29.49 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  25.46 
 
 		 383 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  29.16 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 		 409 aa  132  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  25.2 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  25.2 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  25.33 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  25.33 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  25.89 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  30.79 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  28.97 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  26.84 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  28.97 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  26.87 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  29.8 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6328  aminotransferase class I and II  35.47 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>