More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1998 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 383 aa  775    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  67.64 
 
 		 385 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  67.73 
 
 		 392 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  67.73 
 
 		 385 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  62.93 
 
 		 381 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  61.46 
 
 		 386 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  58.87 
 
 		 376 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  55.24 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  51.07 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  47.34 
 
 		 384 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  48.84 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  49.61 
 
 		 385 aa  352  8.999999999999999e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  45.84 
 
 		 379 aa  349  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  48.45 
 
 		 390 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  45.07 
 
 		 375 aa  345  8e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  43.26 
 
 		 391 aa  315  9e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  44.06 
 
 		 395 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  41.09 
 
 		 386 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  39.1 
 
 		 378 aa  293  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  43.26 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  39.68 
 
 		 521 aa  283  5.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  37.37 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  37.37 
 
 		 393 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  39.9 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  42.71 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  36.75 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  41.09 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  36.48 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  36.48 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  36.22 
 
 		 383 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  36.22 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  35.96 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  36.22 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  35.96 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  37.69 
 
 		 393 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  35.34 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  38.44 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  35.7 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  35.7 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  40.1 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  41.6 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  40.57 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 393 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  39.75 
 
 		 409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  40.85 
 
 		 514 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  41.09 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  38.99 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  40.26 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  40.44 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  40.2 
 
 		 398 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  36.86 
 
 		 390 aa  249  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  38.36 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  35.49 
 
 		 412 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  40.15 
 
 		 390 aa  245  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  35.38 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  36.22 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  36.6 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  37.11 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  35.4 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  34.19 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  34.43 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  38.62 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  38.36 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  35.32 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  37.11 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 		 386 aa  232  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  35.96 
 
 		 392 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  35.96 
 
 		 392 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  38.92 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  36.1 
 
 		 372 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  32.9 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  38.6 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  38.52 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  35.25 
 
 		 394 aa  229  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  32.72 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  36.36 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  35.37 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  33.08 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  32.57 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  38.56 
 
 		 391 aa  225  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  36.73 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  31.87 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  35.31 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  32.72 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  35.38 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  35.38 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  35.38 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  35.38 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  33.59 
 
 		 417 aa  212  7e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  35.38 
 
 		 390 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  35.38 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  35.38 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  35.38 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  35.38 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>