More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0562 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  100 
 
 
391 aa  792    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  61.2 
 
 
386 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  52.58 
 
 
385 aa  361  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  42.12 
 
 
417 aa  342  5e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3079  aminotransferase class I and II  43.6 
 
 
394 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171547  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  42.3 
 
 
390 aa  288  9e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  37.86 
 
 
514 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  39.01 
 
 
415 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  39.65 
 
 
421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  39.84 
 
 
381 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  37.83 
 
 
407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 
385 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 
385 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  35.68 
 
 
390 aa  229  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  36.91 
 
 
386 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  34.26 
 
 
390 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  36.51 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 
391 aa  226  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  37.28 
 
 
392 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  38.56 
 
 
383 aa  225  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  36.08 
 
 
401 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  38.42 
 
 
394 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  37.76 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  30.87 
 
 
383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  38.89 
 
 
383 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 
400 aa  218  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  36.1 
 
 
381 aa  215  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  36.18 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  30.5 
 
 
383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  29.82 
 
 
383 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  30.5 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  29.97 
 
 
383 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  30.5 
 
 
383 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 
395 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  31.03 
 
 
383 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  30.77 
 
 
383 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 
392 aa  209  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  30.24 
 
 
383 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  30.24 
 
 
383 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  35.15 
 
 
405 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 
386 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  31.46 
 
 
389 aa  207  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  32.19 
 
 
393 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  34.14 
 
 
409 aa  205  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  34.73 
 
 
394 aa  205  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  30.61 
 
 
372 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  34.27 
 
 
394 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  32.29 
 
 
390 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  33.33 
 
 
404 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  31.93 
 
 
393 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  29.02 
 
 
383 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  29.74 
 
 
386 aa  203  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  34.43 
 
 
392 aa  203  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 
391 aa  202  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  31.66 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  31.87 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  32.87 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  34.64 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2509  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  39.14 
 
 
370 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  35.5 
 
 
393 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  32.14 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  36.34 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  30.53 
 
 
390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  32 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  33.76 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  34.96 
 
 
383 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 
521 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  32.46 
 
 
412 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  34.2 
 
 
384 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  35.53 
 
 
376 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  33.6 
 
 
398 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  34.07 
 
 
390 aa  189  5.999999999999999e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  31.81 
 
 
393 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  33.88 
 
 
379 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  29.61 
 
 
388 aa  187  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  34.29 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  29.95 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  32.73 
 
 
386 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  30.08 
 
 
387 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 
386 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  36.59 
 
 
399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  32.44 
 
 
392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  28.57 
 
 
397 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  31.63 
 
 
390 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  28.13 
 
 
393 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  34.83 
 
 
385 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  34.83 
 
 
385 aa  177  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
390 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  31.89 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  31.59 
 
 
402 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  32.2 
 
 
394 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  28.23 
 
 
383 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 
386 aa  168  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10930  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  31.03 
 
 
405 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34112  unclonable  0.00000000328438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  31.04 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  31.38 
 
 
393 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>