More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6332 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  100 
 
 
394 aa  788    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  50.54 
 
 
370 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  42.12 
 
 
514 aa  288  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  38.34 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  39.42 
 
 
386 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  39.06 
 
 
390 aa  225  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  38.42 
 
 
391 aa  224  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  38.71 
 
 
381 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  38.38 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  40.2 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  36.76 
 
 
395 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  39.31 
 
 
383 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  35.04 
 
 
384 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  35.17 
 
 
392 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  36.94 
 
 
390 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 
390 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  39.52 
 
 
385 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 
383 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  35.36 
 
 
392 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  39.4 
 
 
390 aa  203  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  35.29 
 
 
391 aa  202  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 
405 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  35.36 
 
 
385 aa  202  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 
412 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  38.77 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  32.72 
 
 
386 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  38.32 
 
 
386 aa  201  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6328  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 
397 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  34.62 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  34.48 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  38.24 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 
386 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
393 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  36.36 
 
 
396 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  35.41 
 
 
398 aa  196  8.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  36.99 
 
 
386 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  37.43 
 
 
390 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  37.41 
 
 
407 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  31.16 
 
 
393 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  34.77 
 
 
386 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  30.9 
 
 
393 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  30.65 
 
 
393 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  34.16 
 
 
386 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 
383 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  34.2 
 
 
409 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  30.05 
 
 
521 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  35.36 
 
 
385 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  35.36 
 
 
385 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  34.74 
 
 
387 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  31.33 
 
 
417 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  39.37 
 
 
384 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  29.95 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  31.12 
 
 
387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  37.57 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  36.09 
 
 
393 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 
393 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  32.47 
 
 
401 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 
391 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  29.22 
 
 
383 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  34.19 
 
 
375 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  36.22 
 
 
414 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  36.24 
 
 
376 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  34.15 
 
 
393 aa  176  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  28.42 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  29.97 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  31.75 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  31.91 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  31.97 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  28.15 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  27.88 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  28.15 
 
 
383 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  31 
 
 
400 aa  173  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  30.43 
 
 
395 aa  173  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  28.15 
 
 
383 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  32.39 
 
 
390 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  28.14 
 
 
389 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  29.92 
 
 
390 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  27.88 
 
 
383 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  27.88 
 
 
383 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  28.15 
 
 
383 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  28.15 
 
 
383 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 
383 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  28.23 
 
 
387 aa  169  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  34.7 
 
 
384 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  28.68 
 
 
390 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  31.27 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  30.43 
 
 
390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  30.16 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  30.16 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  30.16 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2509  aminotransferase class I and II  35.19 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  31.52 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  29.09 
 
 
386 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  29.89 
 
 
390 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  29.89 
 
 
390 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  29.89 
 
 
390 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  29.89 
 
 
390 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  30.83 
 
 
392 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>