More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0703 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 390 aa  805    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  85.49 
 
 		 390 aa  697    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  52.45 
 
 		 386 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  49.48 
 
 		 381 aa  361  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  49.35 
 
 		 385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  48.08 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  48.19 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  48.45 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  46.13 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  45.45 
 
 		 385 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  49.34 
 
 		 376 aa  328  8e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  45.92 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  43.64 
 
 		 379 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  43.38 
 
 		 375 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  43.64 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  39.04 
 
 		 390 aa  302  6.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  38.15 
 
 		 393 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  38.15 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  38.15 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  39.13 
 
 		 391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 		 386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  39.79 
 
 		 521 aa  287  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  36.22 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  36.48 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  40 
 
 		 393 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 		 384 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  35.7 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  35.7 
 
 		 383 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  35.43 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  36.48 
 
 		 383 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  35.43 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  41.07 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  38.5 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  41.77 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  38.99 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  36.32 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  35.17 
 
 		 383 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  35.17 
 
 		 383 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  39.09 
 
 		 400 aa  279  7e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  38.54 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  35.58 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  34.91 
 
 		 383 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  38.8 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  38.58 
 
 		 393 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  40.35 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  38.79 
 
 		 391 aa  272  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  39.04 
 
 		 398 aa  272  6e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  40.42 
 
 		 414 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  39.13 
 
 		 386 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  37.02 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  36.6 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  37.66 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  36 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  34.68 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  35.46 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  38.21 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  38.21 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  33.5 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  39.35 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  39.04 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  39.29 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  36.46 
 
 		 514 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  35.04 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  37.19 
 
 		 390 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  36.27 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  38.58 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  33.33 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  36.04 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  39.24 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  34.88 
 
 		 387 aa  240  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  34.36 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  33.84 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  36.36 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  35.14 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  32.66 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  33.76 
 
 		 386 aa  235  8e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  30.65 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  32.91 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  35.36 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  34.61 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  33.25 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  39.06 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  35.38 
 
 		 392 aa  232  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  32.74 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  35.04 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  35.04 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  35.04 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  35.68 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  35.04 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  34.68 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  34.78 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  32.48 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  32.49 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  32.66 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  33.33 
 
 		 390 aa  215  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  215  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>