More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3628 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 375 aa  776    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  62.53 
 
 		 391 aa  519  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  45.19 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  45.95 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  45.07 
 
 		 383 aa  345  7e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  45.6 
 
 		 386 aa  344  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  41.55 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  46.36 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  40.75 
 
 		 392 aa  326  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  43.55 
 
 		 383 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  41.69 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  41.02 
 
 		 379 aa  309  4e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  43.38 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  41.53 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  39.14 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  42.25 
 
 		 395 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  38.8 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  39.23 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  37.2 
 
 		 521 aa  268  8e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  37.27 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  37.27 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  37.01 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  37.8 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  37.53 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  37.01 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  37.01 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  37.11 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  38.82 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  37.28 
 
 		 412 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  37.01 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  38.76 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  36.22 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  37.24 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  35.08 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  35.16 
 
 		 393 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  36.75 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  35.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  35.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  35.71 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  37.91 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  37.66 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  36.41 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  35.42 
 
 		 391 aa  238  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  32.35 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 		 400 aa  235  8e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  37.84 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  34.79 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  34.04 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  35.6 
 
 		 386 aa  229  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  36.88 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  33.76 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  34.78 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  34.81 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  34.29 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  33.5 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  34.72 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  32.89 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  33.84 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  31.32 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  34.19 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  30.69 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  34.19 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  34.19 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  34.19 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  33.86 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  32.47 
 
 		 390 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  33.93 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  31.69 
 
 		 392 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  31.61 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  32.01 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  33.51 
 
 		 404 aa  202  9e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  31.95 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  34.95 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  33.16 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  32.02 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  32.02 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  31.44 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  30.83 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  32.41 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  32.92 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  35.1 
 
 		 514 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  32.23 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  32.33 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  32.33 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  32.33 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  30.33 
 
 		 397 aa  189  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1347  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  30.55 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>