More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0147 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  87.18 
 
 
390 aa  726    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
390 aa  801    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  87.44 
 
 
390 aa  725    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  66.75 
 
 
389 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  67.18 
 
 
394 aa  541  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  61.28 
 
 
390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  53.33 
 
 
390 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  46.19 
 
 
396 aa  358  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  41.92 
 
 
405 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  37.34 
 
 
393 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  36.64 
 
 
393 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  40.57 
 
 
394 aa  285  7e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  40.66 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  36.39 
 
 
393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  39.07 
 
 
391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  35.04 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  36.39 
 
 
393 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  38.24 
 
 
386 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  37.03 
 
 
397 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  39.28 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  36.92 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  36.5 
 
 
401 aa  273  5.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  34.26 
 
 
397 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  41.37 
 
 
386 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  35.92 
 
 
391 aa  266  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  33.94 
 
 
387 aa  266  7e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  37.85 
 
 
393 aa  266  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  36.53 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  36.67 
 
 
400 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  36.92 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  38.05 
 
 
390 aa  263  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  34.92 
 
 
397 aa  263  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  35.77 
 
 
372 aa  260  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  37.86 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  36.5 
 
 
521 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  38.5 
 
 
385 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  36.99 
 
 
392 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  38.5 
 
 
392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  35.4 
 
 
392 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  35.4 
 
 
392 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 
412 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  32.65 
 
 
383 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 
409 aa  246  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  40.15 
 
 
383 aa  245  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  38.72 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  32.9 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  32.65 
 
 
383 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  31.62 
 
 
383 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  36.32 
 
 
400 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  32.65 
 
 
383 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  33.33 
 
 
387 aa  241  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  36.32 
 
 
400 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  36.32 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  31.36 
 
 
383 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  37.02 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  35.97 
 
 
387 aa  239  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  35.9 
 
 
400 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  36.06 
 
 
400 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  32.47 
 
 
399 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  38.58 
 
 
390 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  31.36 
 
 
383 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  31.36 
 
 
383 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  31.87 
 
 
392 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  31.36 
 
 
383 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  32.32 
 
 
389 aa  237  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  32.55 
 
 
389 aa  236  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  36.69 
 
 
381 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 
383 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  31.11 
 
 
383 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  31.11 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  31.54 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  32.73 
 
 
390 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  36.43 
 
 
385 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  32.48 
 
 
395 aa  230  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  32.38 
 
 
386 aa  230  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  38.23 
 
 
390 aa  229  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  36.34 
 
 
385 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 
385 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  31.62 
 
 
379 aa  227  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  31.71 
 
 
386 aa  226  7e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1347  aminotransferase class I and II  28.94 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 
398 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  33.08 
 
 
383 aa  213  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  29.69 
 
 
388 aa  211  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  33.92 
 
 
402 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  34 
 
 
400 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  34 
 
 
402 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 
402 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 
402 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 
402 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  30.59 
 
 
394 aa  203  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  29.17 
 
 
387 aa  204  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  31.27 
 
 
393 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  28.87 
 
 
378 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  34.55 
 
 
376 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  34.1 
 
 
386 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 
394 aa  196  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 
392 aa  196  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>