More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0455 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  100 
 
 
397 aa  823    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  53.98 
 
 
391 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  49.87 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  47.59 
 
 
393 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  47.85 
 
 
393 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  47.59 
 
 
393 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  44.59 
 
 
391 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  49.75 
 
 
390 aa  355  8.999999999999999e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  43.91 
 
 
390 aa  342  7e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  40.3 
 
 
393 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  45.48 
 
 
386 aa  331  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  41.34 
 
 
401 aa  325  7e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 
397 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  41.43 
 
 
383 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  41.18 
 
 
383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  41.18 
 
 
383 aa  319  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  40.87 
 
 
383 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  40.92 
 
 
383 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  40.92 
 
 
383 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  40.15 
 
 
383 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 
386 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  40.41 
 
 
383 aa  316  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  40.66 
 
 
383 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  40.41 
 
 
383 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  41.62 
 
 
387 aa  312  6.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 
386 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  43.78 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  40.46 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  38.72 
 
 
383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  40.2 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  36.9 
 
 
389 aa  300  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  39.44 
 
 
389 aa  299  6e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  38.92 
 
 
393 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  40.46 
 
 
404 aa  296  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  38.21 
 
 
394 aa  296  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  36.2 
 
 
396 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 
393 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  38.11 
 
 
383 aa  292  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  38.83 
 
 
393 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  36.06 
 
 
392 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  35.7 
 
 
392 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  38.13 
 
 
396 aa  289  6e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  36.13 
 
 
392 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  36.13 
 
 
392 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  35.95 
 
 
393 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 
405 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  37.09 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  36.11 
 
 
397 aa  282  8.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  38.13 
 
 
398 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  37.24 
 
 
390 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  38.11 
 
 
395 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  38.73 
 
 
412 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  37.03 
 
 
390 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  36.87 
 
 
389 aa  272  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  36.02 
 
 
390 aa  272  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  35.64 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  39.03 
 
 
388 aa  270  4e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  35.77 
 
 
390 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  35.55 
 
 
386 aa  270  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  37.02 
 
 
385 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  37.02 
 
 
385 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  37.6 
 
 
387 aa  265  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  38.27 
 
 
394 aa  263  4e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  39.09 
 
 
521 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  34.44 
 
 
400 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  34.44 
 
 
400 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  34.44 
 
 
400 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  34.18 
 
 
400 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  35.35 
 
 
399 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  34.18 
 
 
400 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  34.34 
 
 
390 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  32.22 
 
 
393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 
387 aa  249  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  36.99 
 
 
399 aa  247  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  31.57 
 
 
390 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  35.31 
 
 
385 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  32.07 
 
 
390 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  31.31 
 
 
390 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  31.82 
 
 
390 aa  243  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  31.82 
 
 
390 aa  243  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  31.82 
 
 
390 aa  243  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  31.82 
 
 
390 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  31.82 
 
 
390 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  31.82 
 
 
390 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  34.09 
 
 
385 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  31.82 
 
 
390 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  35.4 
 
 
402 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  30.15 
 
 
390 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 
390 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  36.16 
 
 
400 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  35.15 
 
 
402 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  35.15 
 
 
402 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 
402 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  34.43 
 
 
383 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  34.1 
 
 
392 aa  235  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  33.08 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1347  aminotransferase class I and II  35.38 
 
 
381 aa  233  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>