More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7854 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 412 aa  855    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  53.98 
 
 		 392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  51.41 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1840  putative aminotransferase protein  62.65 
 
 		 292 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.118239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  43.64 
 
 		 393 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  43.64 
 
 		 393 aa  342  9e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  43.38 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 386 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  42.89 
 
 		 397 aa  332  6e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  42.46 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  41.58 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  42.49 
 
 		 391 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  42.05 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  41.09 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  37.5 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  37.24 
 
 		 383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  37.5 
 
 		 383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  37.24 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  37.24 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  37.76 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  37.5 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  37.5 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  42.2 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  37.24 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  37.69 
 
 		 393 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  37.24 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  38.87 
 
 		 401 aa  293  5e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  38.7 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  39.02 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  37.63 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  37.05 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  38.73 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  36.6 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 		 385 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  37.4 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  39.43 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  36.27 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  35.97 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  36.58 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 		 385 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  36.99 
 
 		 391 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  34.2 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  36.1 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  37.05 
 
 		 392 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  37.28 
 
 		 375 aa  259  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  36.53 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  34.44 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  37.91 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  36.44 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  33.67 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  35.44 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  34.02 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  35.62 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  34.44 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  35.49 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  34.37 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  35.04 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  38.05 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  38.05 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  36.6 
 
 		 384 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  34.18 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  35.7 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  33.16 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  35.23 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  38.99 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  34.94 
 
 		 521 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  36.5 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  36.09 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  34.53 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  35.92 
 
 		 400 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  35.92 
 
 		 400 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  35.66 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  35.92 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  32.49 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  32.91 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  35.66 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  34.81 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  36.18 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  33.76 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  35.71 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  36.18 
 
 		 402 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  35.68 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  35.68 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  35.68 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  30.95 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  31.51 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  33.08 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  32.23 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  30.61 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  31.25 
 
 		 514 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>