More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1840 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1840  putative aminotransferase protein  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.118239 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  62.65 
 
 		 412 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  54.18 
 
 		 393 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  55.38 
 
 		 392 aa  295  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  42.23 
 
 		 386 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  44.05 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  44.27 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  41.04 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  41.77 
 
 		 393 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  42.17 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  41.77 
 
 		 393 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  43.82 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  41.6 
 
 		 390 aa  205  6e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  38.91 
 
 		 397 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  40.4 
 
 		 391 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  40.89 
 
 		 385 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  33.47 
 
 		 383 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  36.44 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  39.6 
 
 		 386 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  34.01 
 
 		 383 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  34.8 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  37.3 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  43.14 
 
 		 386 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  34.26 
 
 		 393 aa  178  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  36.69 
 
 		 401 aa  178  9e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  34.01 
 
 		 383 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  40.33 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  42.32 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  34.01 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  34.01 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  33.69 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  34.01 
 
 		 383 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  35.51 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  34.41 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  34.01 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  34.01 
 
 		 383 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  33.6 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  33.6 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  38.49 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  38.25 
 
 		 392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  37.75 
 
 		 392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  37.75 
 
 		 392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  38.65 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  38.65 
 
 		 392 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  38.68 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  38.62 
 
 		 393 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  36.4 
 
 		 390 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  41.13 
 
 		 376 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  36 
 
 		 390 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  37.7 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  40.4 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  34.26 
 
 		 394 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  37.85 
 
 		 385 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  38.65 
 
 		 383 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  38.25 
 
 		 400 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  36.08 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  35.6 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  36.78 
 
 		 390 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  38.1 
 
 		 398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  35.18 
 
 		 395 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  35.57 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  36.55 
 
 		 392 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  31.34 
 
 		 397 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  37.55 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  35.6 
 
 		 390 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  32.13 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 		 394 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  38.34 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  38.34 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  33.2 
 
 		 390 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 		 514 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  37.94 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  35.66 
 
 		 393 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  36.03 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  37.94 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  37.05 
 
 		 395 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  36.36 
 
 		 390 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  36.36 
 
 		 390 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  34.4 
 
 		 389 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 390 aa  155  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 390 aa  155  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  36.36 
 
 		 390 aa  155  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  36.36 
 
 		 390 aa  155  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  34.63 
 
 		 409 aa  155  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  35.93 
 
 		 390 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  35.93 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  35.93 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  36 
 
 		 386 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  33.74 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  31.5 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1614  cystathionine beta-lyase  33.33 
 
 		 389 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  37.45 
 
 		 399 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  38.06 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  33.88 
 
 		 391 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  36.86 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  31.88 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  34.15 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  37.55 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  31.85 
 
 		 521 aa  146  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>