More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2008 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  98.97 
 
 		 390 aa  810    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 390 aa  815    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 390 aa  815    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  100 
 
 		 390 aa  815    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  98.72 
 
 		 390 aa  807    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  98.97 
 
 		 390 aa  810    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  99.23 
 
 		 390 aa  811    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  80.26 
 
 		 390 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  100 
 
 		 390 aa  815    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  98.97 
 
 		 390 aa  810    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  75.58 
 
 		 390 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  70.44 
 
 		 393 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1614  cystathionine beta-lyase  55.41 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2960  aminotransferase, classes I and II  36.01 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  37.15 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  40.1 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  36.67 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  34.18 
 
 		 390 aa  262  6.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  37.37 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  32.82 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  33.59 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  33.59 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  36.53 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  36.53 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  33.33 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  31.82 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  35.35 
 
 		 398 aa  242  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  31.46 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  31.36 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  32.47 
 
 		 521 aa  233  6e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  34.88 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  34.01 
 
 		 381 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  31.96 
 
 		 401 aa  229  9e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  33.76 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  31.62 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  32.56 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  32.3 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  32.36 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  35.42 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  32.04 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  31.31 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  31.96 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  31.52 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  31.7 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  31.52 
 
 		 383 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  31.7 
 
 		 383 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  30.61 
 
 		 383 aa  219  7e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  32.1 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  30.28 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  31.73 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  34.94 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  31.96 
 
 		 386 aa  217  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  31.27 
 
 		 383 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  31.27 
 
 		 383 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  35.38 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  29.87 
 
 		 409 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  33.08 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  33.07 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  29.9 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  29.79 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  32.48 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  33.95 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  29.7 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  28.57 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  30.1 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  35.01 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  31.76 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  29.56 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  31.83 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1710  protein MalY  76.61 
 
 		 131 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.744207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  32.48 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  31.71 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  30.41 
 
 		 390 aa  192  6e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 		 402 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  31.86 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  31.86 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  31.16 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  31.44 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  29.74 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  29.43 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  31.86 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>