More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0412 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  100 
 
 
386 aa  790    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  63.87 
 
 
390 aa  492  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  44.33 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  43.73 
 
 
387 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  41.07 
 
 
390 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  39.34 
 
 
390 aa  269  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  35.86 
 
 
390 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 
391 aa  248  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  40.75 
 
 
385 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  40.6 
 
 
385 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 
392 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  36.96 
 
 
391 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  38.32 
 
 
395 aa  243  6e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 
385 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  36.68 
 
 
514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  34.63 
 
 
401 aa  233  5e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  38.92 
 
 
383 aa  232  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  39.08 
 
 
381 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  38.87 
 
 
405 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  36.61 
 
 
372 aa  229  9e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  35.89 
 
 
394 aa  225  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  35.34 
 
 
386 aa  224  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  32.74 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  35.87 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 
397 aa  220  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  38.44 
 
 
383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  36.01 
 
 
386 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  37.37 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  33.6 
 
 
392 aa  219  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  31.41 
 
 
383 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  35.92 
 
 
385 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  35.83 
 
 
379 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  35.92 
 
 
385 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  32.87 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  37.53 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  30.63 
 
 
383 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  30.37 
 
 
383 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  33.8 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  31.08 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  31.08 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  30.37 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  30.1 
 
 
383 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  30.1 
 
 
383 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  38.67 
 
 
396 aa  213  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  30.81 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  32.22 
 
 
389 aa  212  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  36.26 
 
 
393 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
521 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  30.54 
 
 
383 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  29.81 
 
 
393 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  37.23 
 
 
398 aa  211  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  29.81 
 
 
393 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 
383 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  29.54 
 
 
393 aa  209  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 
409 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 
393 aa  202  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  36.93 
 
 
376 aa  202  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  34.24 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  34.35 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  34.55 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  31.77 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  32.08 
 
 
387 aa  196  6e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  34.69 
 
 
384 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  33.98 
 
 
392 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  32.79 
 
 
390 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  32.79 
 
 
390 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  33.61 
 
 
393 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  34.77 
 
 
394 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  32.79 
 
 
390 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  33.79 
 
 
383 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  32.79 
 
 
390 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  36.6 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  33.79 
 
 
396 aa  190  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  32.35 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  31.64 
 
 
383 aa  189  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  34.44 
 
 
390 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  32.52 
 
 
390 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  32.52 
 
 
390 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  32.52 
 
 
390 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  32.52 
 
 
390 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  29.75 
 
 
397 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  30.98 
 
 
389 aa  187  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  32.25 
 
 
390 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 
394 aa  186  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  33.24 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  32.17 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  33.43 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  32.99 
 
 
375 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  32.68 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  33.89 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  33.15 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1952  bifunctional PLP-dependent enzyme  33.78 
 
 
403 aa  182  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 
390 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  32.73 
 
 
391 aa  182  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  33.15 
 
 
386 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  32.11 
 
 
390 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2960  aminotransferase, classes I and II  27.63 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  33.06 
 
 
387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  30.36 
 
 
400 aa  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>