172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2200 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2200  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  630  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2433  hypothetical protein  41.61 
 
 
296 aa  225  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0205687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1314  hypothetical protein  45.33 
 
 
293 aa  205  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000692688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0654  hypothetical protein  49.79 
 
 
268 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21040  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  53.12 
 
 
263 aa  196  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0674  hypothetical protein  44.4 
 
 
278 aa  192  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1777  hypothetical protein  45.89 
 
 
260 aa  179  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00129852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0374  hypothetical protein  47.69 
 
 
266 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0384  hypothetical protein  47.69 
 
 
266 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0672  Appr-1-p processing domain protein  43.36 
 
 
257 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1058  hypothetical protein  45 
 
 
272 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  42.64 
 
 
612 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0169  Appr-1-p processing domain protein  54.17 
 
 
255 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  42.55 
 
 
583 aa  149  5e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0668  appr-1-p processing domain-containing protein  43.58 
 
 
195 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000230375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2036  phosphatase  44.94 
 
 
175 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1830  Appr-1-p processing  43.96 
 
 
173 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0472  ADP-ribose binding protein  42.22 
 
 
174 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0450  Appr-1-p processing domain protein  41.85 
 
 
175 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5248  Appr-1-p processing domain protein  41.27 
 
 
190 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1354  Appr-1-p processing domain protein  43.6 
 
 
173 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0232  appr-1-p processing domain-containing protein  40 
 
 
176 aa  122  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173543  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1777  histone macroH2A1 family phosphatase  42.35 
 
 
168 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185249  hitchhiker  0.0000000643755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0334  hypothetical protein  42.53 
 
 
171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16620  hypothetical protein  41.76 
 
 
173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0863  Appr-1-p processing domain protein  41.76 
 
 
177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0972  tryptophan--tRNA ligase  41.57 
 
 
183 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00655598  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00650  conserved hypothetical protein  39.78 
 
 
252 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  39.46 
 
 
177 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0268  appr-1-p processing domain-containing protein  41.62 
 
 
184 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0923  Appr-1-p processing  42.37 
 
 
174 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.622442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0611  appr-1-p processing domain-containing protein  39.78 
 
 
172 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1797  Appr-1-p processing domain protein  43.6 
 
 
180 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2347  appr-1-p processing domain-containing protein  40.54 
 
 
194 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.121233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2839  appr-1-p processing domain-containing protein  40.23 
 
 
183 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0526  hypothetical protein  42.01 
 
 
173 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  38.92 
 
 
177 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3211  hypothetical protein  40.76 
 
 
199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  0.647746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  42.46 
 
 
174 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0859  Appr-1-p processing domain protein  41.21 
 
 
177 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0197  hypothetical protein  41.38 
 
 
171 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3642  hypothetical protein  40.91 
 
 
176 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.50575  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0135  Appr-1-p processing  40.54 
 
 
186 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0153995  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2058  Appr-1-p processing protein  39.78 
 
 
175 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1779  hypothetical protein  41.9 
 
 
164 aa  114  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0869  Appr-1-p processing domain protein  36.56 
 
 
190 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6181  Appr-1-p processing enzyme  41.18 
 
 
174 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  37.16 
 
 
180 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0811  Appr-1-p processing  40.11 
 
 
177 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2863  appr-1-p processing domain-containing protein  40.59 
 
 
174 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.590982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2238  Appr-1-p processing  40 
 
 
174 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2852  appr-1-p processing domain-containing protein  40 
 
 
174 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0539  Appr-1-p processing domain protein  40.35 
 
 
182 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.771533  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5392  hypothetical protein  38.54 
 
 
186 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0421  appr-1-p processing domain-containing protein  41.53 
 
 
177 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02120  hypothetical protein  38.33 
 
 
179 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4176  putative appr-1-p processing enzyme  40.59 
 
 
182 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08080  Appr-1-p processing domain protein  35.71 
 
 
188 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000460081  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0191  hypothetical protein  39.53 
 
 
170 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.972198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2907  appr-1-p processing domain-containing protein  37.97 
 
 
174 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2769  appr-1-p processing domain-containing protein  38.12 
 
 
174 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03153  LRP16 family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13850)  38.22 
 
 
374 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.942409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1195  hypothetical protein  46.15 
 
 
171 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.333135  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0491  Appr-1-p processing domain-containing protein  39.66 
 
 
171 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1795  appr-1-p processing domain-containing protein  39.33 
 
 
167 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3007  Appr-1-p processing  39.64 
 
 
173 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.946141  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  40 
 
 
177 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3638  appr-1-p processing domain-containing protein  38.46 
 
 
166 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346618  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0451  appr-1-p processing domain-containing protein  37.97 
 
 
174 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  46.27 
 
 
176 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0667  Appr-1-p processing enzyme family protein  40.44 
 
 
188 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0502  hypothetical protein  40.44 
 
 
188 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2844  hypothetical protein  40.44 
 
 
188 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1561  hypothetical protein  39.77 
 
 
180 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156114  normal  0.618958 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3203  hypothetical protein  40.44 
 
 
177 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0175  hypothetical protein  40.44 
 
 
177 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1417  hypothetical protein  40.44 
 
 
177 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93453  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16260  hypothetical protein  37.14 
 
 
175 aa  105  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0909717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0484  hypothetical protein  39.34 
 
 
177 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1214  hypothetical protein  39.77 
 
 
179 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.166564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1925  Appr-1-p processing domain protein  39.04 
 
 
184 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000389838  unclonable  0.0000000101256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0554  appr-1-p processing domain-containing protein  39.77 
 
 
180 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2042  hypothetical protein  39.77 
 
 
179 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00293711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  40.33 
 
 
173 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1243  hypothetical protein  39.2 
 
 
179 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1258  hypothetical protein  39.2 
 
 
179 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.668213 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2634  appr-1-p processing domain-containing protein  42.01 
 
 
177 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2226  hypothetical protein  39.77 
 
 
179 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1417  Appr-1-p processing  37.85 
 
 
173 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.272769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  38.89 
 
 
181 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  36.72 
 
 
170 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1059  Appr-1-p processing domain protein  40.46 
 
 
163 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1445  hypothetical protein  40.56 
 
 
173 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.264939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4555  appr-1-p processing domain-containing protein  37.5 
 
 
173 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1844  Appr-1-p processing  37.29 
 
 
173 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73513  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  36.11 
 
 
173 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  36.26 
 
 
197 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0164  Appr-1-p processing domain protein  39.66 
 
 
173 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.322732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0271  appr-1-p processing domain-containing protein  38.69 
 
 
183 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30120  hypothetical protein  34.83 
 
 
173 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>