More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3057 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_14470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.08 
 
 
859 aa  639    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21840  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  47.07 
 
 
866 aa  671    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.54 
 
 
847 aa  676    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000329891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2060  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  55.56 
 
 
831 aa  852    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1880  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  57.75 
 
 
861 aa  897    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114017  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6081  Phenylalanine--tRNA ligase  53.31 
 
 
838 aa  817    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3032  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  58.35 
 
 
820 aa  865    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2988  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.88 
 
 
832 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353337  normal  0.0506436 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2408  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.81 
 
 
830 aa  751    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3065  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  54.49 
 
 
828 aa  820    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3176  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.29 
 
 
848 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.388314  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2842  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.56 
 
 
824 aa  736    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150751  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12300  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  49.29 
 
 
844 aa  736    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447276  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.48 
 
 
859 aa  694    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25640  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  54.03 
 
 
838 aa  832    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.811582  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11667  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.1 
 
 
831 aa  736    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000015239  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2146  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  57.35 
 
 
822 aa  839    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0841125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  54.23 
 
 
834 aa  819    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2973  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.82 
 
 
832 aa  721    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388025  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5464  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.15 
 
 
825 aa  755    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22370  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  51.66 
 
 
854 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2377  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.65 
 
 
832 aa  694    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1512  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3532  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.14 
 
 
832 aa  743    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996283  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1734  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.68 
 
 
865 aa  723    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236213  decreased coverage  0.000664973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.19 
 
 
859 aa  785    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1887  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  57.24 
 
 
861 aa  855    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447501  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1109  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.88 
 
 
854 aa  713    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.387585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1490  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.18 
 
 
847 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.35538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1264  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  55.06 
 
 
824 aa  781    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.291757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2466  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  53 
 
 
827 aa  763    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.58 
 
 
845 aa  771    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3017  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.82 
 
 
832 aa  721    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.599618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3316  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.72 
 
 
828 aa  763    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3057  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 
827 aa  1646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719284  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3163  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.04 
 
 
854 aa  734    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467401  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1322  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.78 
 
 
864 aa  752    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0818  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.3 
 
 
867 aa  630  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0672  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.19 
 
 
873 aa  628  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.51 
 
 
789 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.52 
 
 
806 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.263312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1423  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.61 
 
 
804 aa  445  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0017592  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1662  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.4 
 
 
793 aa  443  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  37.74 
 
 
797 aa  446  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4686  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.76 
 
 
806 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.406058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4455  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.51 
 
 
806 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4293  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.51 
 
 
806 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.39 
 
 
806 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4803  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.51 
 
 
806 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4674  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.51 
 
 
806 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.71492e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.18 
 
 
804 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.329068  normal  0.33512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2056  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.95 
 
 
790 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0568  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.75 
 
 
806 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0636617  hitchhiker  0.0000135614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0811  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.7 
 
 
804 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3248  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.4 
 
 
806 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4686  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.64 
 
 
806 aa  439  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140793  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04690  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.12 
 
 
811 aa  438  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4671  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.75 
 
 
806 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204135  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.04 
 
 
800 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.04 
 
 
800 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2648  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.22 
 
 
804 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2672  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.21 
 
 
794 aa  432  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4391  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.52 
 
 
806 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.91 
 
 
795 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.84 
 
 
794 aa  429  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.03 
 
 
795 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0368  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  34.72 
 
 
796 aa  428  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.43 
 
 
814 aa  429  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.978211  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2765  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.07 
 
 
793 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2149  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.29 
 
 
795 aa  425  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625217  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.79 
 
 
795 aa  426  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1054  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.09 
 
 
819 aa  423  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2049  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.89 
 
 
794 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2638  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.7 
 
 
793 aa  422  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1750  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  38.93 
 
 
803 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000980534  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0917  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.87 
 
 
786 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.22 
 
 
795 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.468133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1981  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.99 
 
 
792 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134276  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.18 
 
 
801 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00584126  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0432  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.2 
 
 
792 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1038  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.04 
 
 
835 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.57 
 
 
795 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1956  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.32 
 
 
795 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05640  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.37 
 
 
799 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.87 
 
 
801 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.157049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.74 
 
 
792 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2597  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.81 
 
 
795 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0200655  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2418  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.94 
 
 
795 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000318266  hitchhiker  0.0000890505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.94 
 
 
795 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2185  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.12 
 
 
795 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.861692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.45 
 
 
795 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1893  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.64 
 
 
795 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.09 
 
 
795 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1440  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.5 
 
 
833 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.76 
 
 
793 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24212  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.29 
 
 
792 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1908  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.69 
 
 
795 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00255913  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.97 
 
 
795 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1473  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.97 
 
 
792 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000187632  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1145  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.53 
 
 
793 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158362  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.57 
 
 
816 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>