More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12300 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3057  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.29 
 
 
827 aa  736    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719284  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0672  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.92 
 
 
873 aa  710    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2377  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.98 
 
 
832 aa  771    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1512  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.29 
 
 
834 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2060  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.53 
 
 
831 aa  759    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3163  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  54.22 
 
 
854 aa  831    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467401  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.08 
 
 
859 aa  714    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5464  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.34 
 
 
825 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.28 
 
 
847 aa  757    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000329891 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  54.61 
 
 
859 aa  801    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0818  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.82 
 
 
867 aa  707    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21840  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  49.71 
 
 
866 aa  743    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12300  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  100 
 
 
844 aa  1683    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447276  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2842  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.09 
 
 
824 aa  637    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1887  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.41 
 
 
861 aa  705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447501  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3065  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.82 
 
 
828 aa  727    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25640  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  49.47 
 
 
838 aa  719    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.811582  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1109  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.86 
 
 
854 aa  779    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.387585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1880  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.31 
 
 
861 aa  725    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114017  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1734  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.48 
 
 
865 aa  678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236213  decreased coverage  0.000664973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6081  Phenylalanine--tRNA ligase  47.49 
 
 
838 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22370  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  54.65 
 
 
854 aa  797    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1322  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  54.37 
 
 
864 aa  807    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2146  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.24 
 
 
822 aa  692    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0841125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.54 
 
 
859 aa  668    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.41 
 
 
845 aa  681    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1490  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50 
 
 
847 aa  763    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.35538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1264  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.06 
 
 
824 aa  706    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.291757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2466  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  51.83 
 
 
827 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3032  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.59 
 
 
820 aa  693    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3176  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.6 
 
 
848 aa  618  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.388314  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2408  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.32 
 
 
830 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3316  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.5 
 
 
828 aa  599  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3532  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.11 
 
 
832 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996283  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2973  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.25 
 
 
832 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3017  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.25 
 
 
832 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.599618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2988  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.25 
 
 
832 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353337  normal  0.0506436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11667  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.93 
 
 
831 aa  535  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000015239  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.53 
 
 
806 aa  429  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.263312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1423  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.14 
 
 
804 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0017592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.15 
 
 
801 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00584126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.31 
 
 
789 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1054  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.28 
 
 
819 aa  416  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.49 
 
 
800 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05640  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.29 
 
 
799 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.88 
 
 
814 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.978211  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.49 
 
 
800 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1750  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  37.7 
 
 
803 aa  409  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000980534  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2049  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.06 
 
 
794 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2648  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.57 
 
 
804 aa  406  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0722  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.1 
 
 
800 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.898313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2623  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.48 
 
 
801 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3248  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.79 
 
 
806 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1377  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.78 
 
 
800 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4391  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.1 
 
 
806 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11820  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.71 
 
 
825 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4671  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.1 
 
 
806 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204135  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04690  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.32 
 
 
811 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4686  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.98 
 
 
806 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.406058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4674  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.98 
 
 
806 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.71492e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4455  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.98 
 
 
806 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4293  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.98 
 
 
806 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.98 
 
 
806 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4686  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.98 
 
 
806 aa  399  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2360  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.03 
 
 
812 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4803  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.98 
 
 
806 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0568  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.98 
 
 
806 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0636617  hitchhiker  0.0000135614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3743  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.52 
 
 
835 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.98 
 
 
792 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0917  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.16 
 
 
786 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1416  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.49 
 
 
801 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0211445  normal  0.563013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3616  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.82 
 
 
803 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433248  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.12 
 
 
792 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0811  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.19 
 
 
804 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1293  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.79 
 
 
810 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.28 
 
 
795 aa  389  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.468133  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4963  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.09 
 
 
811 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00596015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.9 
 
 
797 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0429  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.18 
 
 
800 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.473039  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34 
 
 
794 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0396  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.93 
 
 
817 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180905  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.36 
 
 
804 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.329068  normal  0.33512 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1267  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.05 
 
 
816 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2056  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.68 
 
 
790 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2672  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.26 
 
 
794 aa  379  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.07 
 
 
801 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.157049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2063  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.76 
 
 
817 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0478558  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1520  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.37 
 
 
801 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2833  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.37 
 
 
812 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3264  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
812 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00381617  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1936  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.93 
 
 
792 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927196  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.26 
 
 
801 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4756  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
809 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1981  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.11 
 
 
792 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134276  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.35 
 
 
792 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2225  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.37 
 
 
801 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1884  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.5 
 
 
800 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1038  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.47 
 
 
835 aa  373  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2221  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.86 
 
 
810 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655729  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1971  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.87 
 
 
800 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>