More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2408 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.94 
 
 
834 aa  742    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3065  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.48 
 
 
828 aa  710    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1887  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.23 
 
 
861 aa  688    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447501  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2408  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
830 aa  1637    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2988  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.67 
 
 
832 aa  957    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353337  normal  0.0506436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3032  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.37 
 
 
820 aa  754    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2060  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.59 
 
 
831 aa  758    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25640  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  55.53 
 
 
838 aa  860    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.811582  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1322  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.71 
 
 
864 aa  640    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1734  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.4 
 
 
865 aa  668    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236213  decreased coverage  0.000664973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3532  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.33 
 
 
832 aa  944    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996283  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11667  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  60.4 
 
 
831 aa  914    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000015239  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2973  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.67 
 
 
832 aa  957    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.8 
 
 
845 aa  741    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6081  Phenylalanine--tRNA ligase  48.29 
 
 
838 aa  714    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1880  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.92 
 
 
861 aa  718    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114017  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12300  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  46.35 
 
 
844 aa  658    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447276  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2842  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  63.7 
 
 
824 aa  971    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5464  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  58.09 
 
 
825 aa  825    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2146  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.11 
 
 
822 aa  764    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0841125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3057  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.81 
 
 
827 aa  798    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719284  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3163  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.91 
 
 
854 aa  678    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467401  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1264  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.83 
 
 
824 aa  683    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.291757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2466  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  48.69 
 
 
827 aa  675    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3017  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.67 
 
 
832 aa  957    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.599618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.31 
 
 
859 aa  704    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3316  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.08 
 
 
828 aa  992    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21840  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  45.22 
 
 
866 aa  635  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3176  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.91 
 
 
848 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.388314  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1109  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.31 
 
 
854 aa  628  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.387585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22370  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  49.21 
 
 
854 aa  627  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2377  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.32 
 
 
832 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1512  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.51 
 
 
859 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1490  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.84 
 
 
847 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.35538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.62 
 
 
847 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000329891 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.37 
 
 
859 aa  568  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0672  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.29 
 
 
873 aa  546  1e-154  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0818  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.19 
 
 
867 aa  539  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.77 
 
 
806 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.263312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04690  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.2 
 
 
811 aa  418  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1423  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.69 
 
 
804 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0017592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.44 
 
 
814 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.978211  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1054  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.3 
 
 
819 aa  404  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3616  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.51 
 
 
803 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433248  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1377  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  37.18 
 
 
800 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.53 
 
 
800 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2049  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.59 
 
 
794 aa  392  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3248  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.9 
 
 
806 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4686  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.55 
 
 
806 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.53 
 
 
800 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4686  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.16 
 
 
806 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.406058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4455  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.27 
 
 
806 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4293  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.27 
 
 
806 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.27 
 
 
806 aa  389  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.57 
 
 
807 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0126985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1604  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.19 
 
 
807 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1662  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.19 
 
 
793 aa  389  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4803  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.27 
 
 
806 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4671  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.04 
 
 
806 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4674  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.27 
 
 
806 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.71492e-23 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11820  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.74 
 
 
825 aa  387  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0368  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  32.74 
 
 
796 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.25 
 
 
789 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1750  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  37.3 
 
 
803 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000980534  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0568  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.2 
 
 
806 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0636617  hitchhiker  0.0000135614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4391  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.8 
 
 
806 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2200  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.53 
 
 
797 aa  381  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1884  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.92 
 
 
800 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1816  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.1 
 
 
819 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.597533  normal  0.483495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2648  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.29 
 
 
804 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1217  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.75 
 
 
805 aa  375  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000796481  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0811  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.88 
 
 
804 aa  376  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0677  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.49 
 
 
801 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2623  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.99 
 
 
801 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417959  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2123  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.65 
 
 
804 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.615312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4271  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.67 
 
 
810 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.04 
 
 
795 aa  373  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2360  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.68 
 
 
812 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1416  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.69 
 
 
801 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0211445  normal  0.563013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
804 aa  373  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.329068  normal  0.33512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1912  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.19 
 
 
850 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.24608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05640  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.81 
 
 
799 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3487  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.07 
 
 
808 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.04 
 
 
795 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2056  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.99 
 
 
790 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.04 
 
 
795 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.77 
 
 
801 aa  368  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.263135  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0797  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
804 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4633  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
838 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.45 
 
 
801 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0917  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.85 
 
 
786 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2298  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.01 
 
 
801 aa  369  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.184232  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2039  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
804 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.9 
 
 
801 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00584126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1267  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.17 
 
 
816 aa  365  2e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3743  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.43 
 
 
835 aa  364  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2225  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.13 
 
 
801 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627818 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3623  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.1 
 
 
798 aa  362  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1956  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.03 
 
 
795 aa  361  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0209  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.88 
 
 
807 aa  361  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.212777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>