More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1322 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1887  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.85 
 
 
861 aa  723    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447501  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3163  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  58.18 
 
 
854 aa  880    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467401  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2146  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.92 
 
 
822 aa  728    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0841125  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12300  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  54.37 
 
 
844 aa  831    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447276  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2842  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.76 
 
 
824 aa  647    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2060  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.44 
 
 
831 aa  772    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1880  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.41 
 
 
861 aa  738    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114017  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3532  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.51 
 
 
832 aa  646    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996283  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1734  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.13 
 
 
865 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236213  decreased coverage  0.000664973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1322  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 
864 aa  1676    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0818  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.35 
 
 
867 aa  874    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2377  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  57.59 
 
 
832 aa  845    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1512  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3032  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.21 
 
 
820 aa  716    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3176  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.79 
 
 
848 aa  660    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.388314  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25640  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  50.58 
 
 
838 aa  741    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.811582  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.65 
 
 
859 aa  710    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.400508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3065  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.17 
 
 
828 aa  723    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1109  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  61.32 
 
 
854 aa  974    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.387585 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0672  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.95 
 
 
873 aa  872    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.09 
 
 
834 aa  734    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22370  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  68.4 
 
 
854 aa  1009    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21840  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  58.11 
 
 
866 aa  885    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6081  Phenylalanine--tRNA ligase  50.82 
 
 
838 aa  742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.71 
 
 
845 aa  732    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  61.92 
 
 
859 aa  942    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.37 
 
 
859 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3057  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.68 
 
 
827 aa  767    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719284  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1490  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.04 
 
 
847 aa  820    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.35538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.25 
 
 
847 aa  769    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000329891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1264  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.23 
 
 
824 aa  719    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.291757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2466  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  52.27 
 
 
827 aa  749    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5464  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.62 
 
 
825 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3316  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.46 
 
 
828 aa  663    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2408  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.71 
 
 
830 aa  627  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2973  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.54 
 
 
832 aa  622  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3017  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.54 
 
 
832 aa  622  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.599618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2988  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.58 
 
 
832 aa  618  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353337  normal  0.0506436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11667  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.72 
 
 
831 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000015239  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.25 
 
 
806 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.263312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.45 
 
 
814 aa  422  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.978211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1423  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.37 
 
 
804 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0017592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3743  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.46 
 
 
835 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
801 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00584126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2623  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.67 
 
 
801 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417959  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04690  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.47 
 
 
811 aa  406  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343492 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3248  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.45 
 
 
806 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2360  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.12 
 
 
812 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0368  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  33.83 
 
 
796 aa  405  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.27 
 
 
804 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.329068  normal  0.33512 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4674  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.3 
 
 
806 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.71492e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4455  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.3 
 
 
806 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4293  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.3 
 
 
806 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4686  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
806 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1416  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.83 
 
 
801 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0211445  normal  0.563013 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4803  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.3 
 
 
806 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2648  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.55 
 
 
804 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.89 
 
 
789 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4686  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
806 aa  399  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.406058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.18 
 
 
806 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.66 
 
 
800 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0568  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.47 
 
 
806 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0636617  hitchhiker  0.0000135614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4391  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
806 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0811  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.49 
 
 
804 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4671  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.03 
 
 
806 aa  399  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204135  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.66 
 
 
800 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2049  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.35 
 
 
794 aa  399  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1054  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.74 
 
 
819 aa  394  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0429  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.98 
 
 
800 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.473039  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
801 aa  389  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.263135  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.3 
 
 
795 aa  389  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.468133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.95 
 
 
801 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.157049  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0722  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.58 
 
 
800 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.898313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1377  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.24 
 
 
800 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1520  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.74 
 
 
801 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2672  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.75 
 
 
794 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1750  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  36.72 
 
 
803 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000980534  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2298  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.19 
 
 
801 aa  382  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.184232  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.95 
 
 
801 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1884  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.74 
 
 
800 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2225  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.56 
 
 
801 aa  376  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.63 
 
 
797 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2800  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.03 
 
 
802 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05640  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.88 
 
 
799 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2673  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.94 
 
 
784 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0449078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3616  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.87 
 
 
803 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433248  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0432  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.22 
 
 
792 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1267  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.91 
 
 
816 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01682  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  34.99 
 
 
795 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0961927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1929  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.99 
 
 
795 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000518334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1449  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.65 
 
 
795 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.29 
 
 
795 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.86 
 
 
807 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0126985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01671  hypothetical protein  34.99 
 
 
795 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0686641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1662  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.72 
 
 
793 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1971  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.81 
 
 
800 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2431  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.99 
 
 
795 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175376  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2007  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.52 
 
 
795 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.693647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1793  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.99 
 
 
795 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000955232  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0844  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.26 
 
 
795 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1918  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.99 
 
 
795 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.333448  normal  0.421493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>