More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1734 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.78 
 
 
859 aa  693    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2146  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  54.2 
 
 
822 aa  790    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0841125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11667  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.98 
 
 
831 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000015239  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3532  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.83 
 
 
832 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996283  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2060  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  54.58 
 
 
831 aa  797    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3057  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.8 
 
 
827 aa  754    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719284  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2408  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.63 
 
 
830 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3176  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  71.86 
 
 
848 aa  1054    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.388314  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2988  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.08 
 
 
832 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353337  normal  0.0506436 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12300  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  48.92 
 
 
844 aa  697    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447276  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25640  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  51.95 
 
 
838 aa  747    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.811582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1734  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 
865 aa  1651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236213  decreased coverage  0.000664973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.79 
 
 
859 aa  792    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3065  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.86 
 
 
828 aa  747    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1880  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.51 
 
 
861 aa  736    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114017  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22370  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  51.38 
 
 
854 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2973  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.97 
 
 
832 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388025  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1322  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.48 
 
 
864 aa  718    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.73 
 
 
845 aa  736    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1109  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.78 
 
 
854 aa  695    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.387585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2842  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.09 
 
 
824 aa  715    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6081  Phenylalanine--tRNA ligase  54.06 
 
 
838 aa  791    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1887  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.4 
 
 
861 aa  725    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447501  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1490  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.87 
 
 
847 aa  694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.35538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5464  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.06 
 
 
825 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3032  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.76 
 
 
820 aa  707    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1264  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  56.26 
 
 
824 aa  793    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.291757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2466  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  50 
 
 
827 aa  696    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  55.39 
 
 
834 aa  815    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3017  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.97 
 
 
832 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.599618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3163  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.5 
 
 
854 aa  688    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467401  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3316  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.03 
 
 
828 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2377  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.92 
 
 
832 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1512  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.58 
 
 
847 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000329891 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21840  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  47.17 
 
 
866 aa  632  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.39 
 
 
859 aa  630  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.400508  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0672  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.95 
 
 
873 aa  625  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0818  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.38 
 
 
867 aa  606  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2056  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.69 
 
 
790 aa  445  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.39 
 
 
806 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.263312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.93 
 
 
804 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.329068  normal  0.33512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.7 
 
 
801 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00584126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1423  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.24 
 
 
804 aa  429  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0017592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1804  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  37.78 
 
 
793 aa  426  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.24 
 
 
814 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.978211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2049  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.64 
 
 
794 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1884  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.05 
 
 
800 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2315  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.15 
 
 
803 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507205  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0368  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  34.45 
 
 
796 aa  419  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1750  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  39.82 
 
 
803 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000980534  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2623  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.99 
 
 
801 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417959  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1054  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.07 
 
 
819 aa  410  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.37 
 
 
795 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.468133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.07 
 
 
789 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1377  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.75 
 
 
800 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1662  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.18 
 
 
793 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1416  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.47 
 
 
801 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0211445  normal  0.563013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.47 
 
 
801 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.157049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4686  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.64 
 
 
806 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4686  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
806 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.406058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4455  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
806 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4293  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
806 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
806 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2765  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.8 
 
 
793 aa  399  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.75 
 
 
801 aa  397  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.263135  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 
794 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4803  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
806 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.4 
 
 
792 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3248  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.79 
 
 
806 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4674  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.41 
 
 
806 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.71492e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.06 
 
 
801 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2638  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.69 
 
 
793 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4671  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.3 
 
 
806 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1936  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.17 
 
 
792 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927196  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2225  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.14 
 
 
801 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04690  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.9 
 
 
811 aa  395  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343492 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2360  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.64 
 
 
812 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.98 
 
 
792 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11820  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.16 
 
 
825 aa  391  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05640  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.23 
 
 
799 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3039  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.44 
 
 
803 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0321898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.98 
 
 
793 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.91 
 
 
816 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0568  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.18 
 
 
806 aa  392  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0636617  hitchhiker  0.0000135614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4391  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.18 
 
 
806 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.02 
 
 
793 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.025038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.87 
 
 
793 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24212  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.4 
 
 
792 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0917  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.59 
 
 
786 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2298  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
801 aa  388  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.184232  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.79 
 
 
803 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1907  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.07 
 
 
800 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2672  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.74 
 
 
794 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1732  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.63 
 
 
795 aa  385  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00878056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.29 
 
 
795 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.03 
 
 
795 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.14 
 
 
795 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.29 
 
 
795 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.29 
 
 
795 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.3 
 
 
795 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>