More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1478 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1478  Adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
170 aa  343  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
173 aa  155  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
172 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 
172 aa  152  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 
173 aa  151  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
171 aa  150  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
173 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
172 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
198 aa  148  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
172 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  41.76 
 
 
173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
182 aa  144  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
176 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
173 aa  142  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
172 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
172 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
172 aa  142  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
178 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
185 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
185 aa  141  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
175 aa  141  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 
184 aa  141  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
170 aa  141  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
179 aa  141  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
187 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
181 aa  140  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
187 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
170 aa  140  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
185 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
170 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
179 aa  140  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
184 aa  140  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 
178 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
170 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 
197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  39.51 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
171 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
183 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 
173 aa  137  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
174 aa  137  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  40.25 
 
 
181 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  43.67 
 
 
178 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
188 aa  137  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
168 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 
181 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
174 aa  136  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
178 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
183 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
183 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
184 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
174 aa  136  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
183 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
183 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
183 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
184 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
183 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
183 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
183 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
183 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
188 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
190 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  40.25 
 
 
181 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  40.24 
 
 
183 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
183 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  41.56 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  45.22 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 
171 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
170 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
184 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
184 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
184 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
184 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
231 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
183 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
183 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
170 aa  134  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
183 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
183 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
214 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>