More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5276 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5276  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 466 aa  909    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420426  normal  0.809704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  60.57 
 
 		 458 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2917  hypothetical protein  61.01 
 
 		 482 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0167  hypothetical protein  61.01 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0462  xanthine/uracil permease family protein  61.01 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.859148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3022  xanthine/uracil permease family protein  61.01 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0980  hypothetical protein  61.01 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2977  hypothetical protein  61.01 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2608  hypothetical protein  61.01 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3105  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.64 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2527  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.93 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0224  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.35 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274555  normal  0.678538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5288  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.46 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.02 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  39.09 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.09 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  39.09 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  38.41 
 
 		 445 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  38.41 
 
 		 445 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  38.41 
 
 		 445 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  38.41 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.51 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.09 
 
 		 445 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.44 
 
 		 429 aa  300  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.18 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5145  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  37.95 
 
 		 445 aa  299  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.164927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03598  predicted inner membrane protein  37.73 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.73 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3928  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.73 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03542  hypothetical protein  37.73 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4223  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.73 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.73 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.66 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.27 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.5 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.73 
 
 		 445 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.55 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.87 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4208  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  37.27 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.3 
 
 		 470 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.3 
 
 		 448 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.19 
 
 		 446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.3 
 
 		 444 aa  289  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.3 
 
 		 444 aa  289  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  36.3 
 
 		 470 aa  289  9e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  36.09 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.3 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  36.09 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.83 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.16 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  40.09 
 
 		 433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  36.63 
 
 		 449 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  38.3 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  36.4 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.46 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  37.95 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.65 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1753  xanthine/uracil permease family protein  34.8 
 
 		 482 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  38.65 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.32 
 
 		 429 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.51 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  38.03 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  35.76 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3208  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.2 
 
 		 436 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.94 
 
 		 431 aa  276  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  38.07 
 
 		 428 aa  276  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.64 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  37.5 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.61 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.5 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3356  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.76 
 
 		 433 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000349173  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.04 
 
 		 433 aa  273  6e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.26 
 
 		 430 aa  272  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.16 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.16 
 
 		 433 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.44 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.49 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.44 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.5 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.76 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  39.32 
 
 		 430 aa  270  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.27 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.27 
 
 		 441 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.16 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.81 
 
 		 446 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  39.32 
 
 		 430 aa  269  8e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  37.95 
 
 		 433 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.96 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.95 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.22 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  37.73 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  37.73 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  37.73 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.36 
 
 		 438 aa  266  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  37.44 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36 
 
 		 463 aa  266  5.999999999999999e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.19 
 
 		 429 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  37.19 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.13 
 
 		 431 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>