More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5288 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5288  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 430 aa  825    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0224  Xanthine/uracil/vitamin C permease  65.72 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274555  normal  0.678538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.46 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  53.58 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3105  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.21 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2527  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.69 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2917  hypothetical protein  53.81 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2977  hypothetical protein  53.81 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0462  xanthine/uracil permease family protein  53.81 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.859148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3022  xanthine/uracil permease family protein  53.81 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2608  hypothetical protein  53.81 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503637  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0980  hypothetical protein  53.81 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0167  hypothetical protein  53.81 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753431  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5276  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.46 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420426  normal  0.809704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.29 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.59 
 
 		 431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  47.53 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.29 
 
 		 431 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.06 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.12 
 
 		 431 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.35 
 
 		 441 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  47.31 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  47.54 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.96 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.02 
 
 		 460 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.05 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.54 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  42.14 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  42.14 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  41.72 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  41.72 
 
 		 445 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.57 
 
 		 445 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03598  predicted inner membrane protein  42.86 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.42 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.86 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03542  hypothetical protein  42.86 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4223  sulfate permease family inorganic anion transporter  42.86 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5145  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  42.86 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.164927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3928  sulfate permease family inorganic anion transporter  42.86 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.88 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  42.19 
 
 		 445 aa  332  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  44.39 
 
 		 433 aa  332  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  41.82 
 
 		 465 aa  332  9e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  41.82 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.39 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.05 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.16 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.16 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  42.14 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.4 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  41.9 
 
 		 442 aa  329  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.9 
 
 		 442 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.06 
 
 		 442 aa  329  7e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.66 
 
 		 431 aa  329  7e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  44.31 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  44.06 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.52 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  44.06 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  44.06 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.8 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  43.1 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.12 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  44.55 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  42.93 
 
 		 429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  44.07 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  40.47 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.86 
 
 		 445 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.55 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.06 
 
 		 433 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.06 
 
 		 433 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.06 
 
 		 433 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  40.7 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4208  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  41.26 
 
 		 445 aa  323  4e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.98 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.04 
 
 		 429 aa  322  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.57 
 
 		 445 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  43.1 
 
 		 453 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  42.22 
 
 		 430 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.28 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.03 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.71 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.47 
 
 		 433 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.45 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  43.1 
 
 		 453 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  41.39 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.33 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.05 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.33 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.32 
 
 		 445 aa  316  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.45 
 
 		 430 aa  316  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.56 
 
 		 445 aa  316  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.1 
 
 		 446 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.3 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  42.22 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  39.95 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  41.08 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.52 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  44.77 
 
 		 494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.05 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.68 
 
 		 443 aa  312  5.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>