More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2742 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2742  elongation factor P  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4562  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  84.04 
 
 
188 aa  334  5.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  83.51 
 
 
187 aa  327  5.0000000000000004e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00382  elongation factor P  91.26 
 
 
183 aa  325  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  61.9 
 
 
190 aa  262  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  61.9 
 
 
190 aa  262  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  63.83 
 
 
188 aa  260  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  57.98 
 
 
189 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  59.79 
 
 
191 aa  249  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  60.64 
 
 
188 aa  246  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  246  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  61.7 
 
 
188 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  245  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  245  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  245  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  245  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  245  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  245  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  61.17 
 
 
188 aa  245  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  61.17 
 
 
188 aa  245  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  59.04 
 
 
188 aa  244  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  60.11 
 
 
189 aa  243  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  60.11 
 
 
188 aa  243  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  59.57 
 
 
189 aa  243  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  60.11 
 
 
188 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  60.11 
 
 
189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  57.98 
 
 
188 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  59.36 
 
 
187 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  60.11 
 
 
188 aa  241  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  57.98 
 
 
189 aa  240  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  60.11 
 
 
188 aa  239  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  60.64 
 
 
188 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  60.64 
 
 
188 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  60.64 
 
 
188 aa  239  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  60.11 
 
 
188 aa  239  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  57.98 
 
 
188 aa  237  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  58.51 
 
 
189 aa  237  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  57.98 
 
 
188 aa  237  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  60.96 
 
 
187 aa  236  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  55.38 
 
 
189 aa  234  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  56.38 
 
 
188 aa  231  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  54.79 
 
 
189 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  54.26 
 
 
189 aa  226  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  53.19 
 
 
188 aa  221  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  55.38 
 
 
191 aa  220  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  52.91 
 
 
191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  52.94 
 
 
191 aa  218  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  54.01 
 
 
188 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0589  translation elongation factor P  49.73 
 
 
189 aa  200  9e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.14592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  48.62 
 
 
187 aa  188  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  46.7 
 
 
188 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  44.15 
 
 
187 aa  168  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  44.15 
 
 
187 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  40.86 
 
 
190 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  43.65 
 
 
185 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  44.38 
 
 
190 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  44.39 
 
 
185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  41.99 
 
 
187 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  43.82 
 
 
190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  43.82 
 
 
190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  44.09 
 
 
189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  44.68 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  43.82 
 
 
190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  43.32 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  40.88 
 
 
185 aa  162  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  41.44 
 
 
187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  43.09 
 
 
186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  42.78 
 
 
185 aa  161  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  44.02 
 
 
204 aa  160  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  44.44 
 
 
185 aa  160  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  44.62 
 
 
189 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  44.62 
 
 
189 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  44.62 
 
 
189 aa  160  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  43.09 
 
 
187 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  44.62 
 
 
189 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  44.2 
 
 
186 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  43.09 
 
 
187 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  44.26 
 
 
187 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  43.09 
 
 
187 aa  158  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  42.25 
 
 
185 aa  158  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  44.2 
 
 
185 aa  158  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0133  elongation factor P  42.02 
 
 
190 aa  157  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  45.99 
 
 
187 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  45 
 
 
185 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  42.62 
 
 
186 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  40.56 
 
 
185 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  39.01 
 
 
194 aa  156  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  44.2 
 
 
185 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  45.36 
 
 
185 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  43.09 
 
 
188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  40.88 
 
 
187 aa  154  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  40.86 
 
 
189 aa  154  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  41.18 
 
 
185 aa  153  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  40.11 
 
 
187 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>