More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0589 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0589  translation elongation factor P  100 
 
 
189 aa  388  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.14592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  69.31 
 
 
188 aa  283  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  61.9 
 
 
188 aa  263  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  62.43 
 
 
188 aa  258  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  62.43 
 
 
188 aa  258  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  62.43 
 
 
188 aa  258  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  62.96 
 
 
188 aa  257  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  59.79 
 
 
188 aa  254  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  62.43 
 
 
188 aa  254  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  61.38 
 
 
188 aa  253  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  61.9 
 
 
189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  59.79 
 
 
189 aa  251  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  59.26 
 
 
189 aa  250  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  59.79 
 
 
188 aa  244  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  56.61 
 
 
189 aa  241  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  57.14 
 
 
188 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  56.61 
 
 
189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  58.2 
 
 
188 aa  238  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  55.03 
 
 
188 aa  236  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  56.08 
 
 
189 aa  236  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  54.74 
 
 
190 aa  235  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  55.03 
 
 
188 aa  234  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  55.03 
 
 
188 aa  234  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  54.74 
 
 
190 aa  234  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  53.72 
 
 
187 aa  231  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  55.32 
 
 
189 aa  232  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  55.79 
 
 
191 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  53.19 
 
 
191 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  54.5 
 
 
188 aa  229  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  53.97 
 
 
188 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  51.85 
 
 
188 aa  225  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  51.85 
 
 
188 aa  225  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  57.45 
 
 
187 aa  224  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  51.58 
 
 
191 aa  219  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  50.79 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  54.35 
 
 
191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  50.79 
 
 
188 aa  210  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  50.26 
 
 
189 aa  209  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  49.74 
 
 
188 aa  207  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  50.26 
 
 
187 aa  205  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2742  elongation factor P  49.73 
 
 
188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4562  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00382  elongation factor P  48.63 
 
 
183 aa  179  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  41.53 
 
 
190 aa  177  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  41.4 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  40.98 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  46.45 
 
 
185 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  44.26 
 
 
190 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  44.26 
 
 
190 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0133  elongation factor P  42.93 
 
 
190 aa  168  5e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  44.26 
 
 
190 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  42.78 
 
 
187 aa  167  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  43.17 
 
 
190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  40.66 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  42.08 
 
 
186 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  41.18 
 
 
187 aa  158  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  42.31 
 
 
185 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  42.39 
 
 
185 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  39.57 
 
 
187 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  41.3 
 
 
188 aa  154  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  40.11 
 
 
187 aa  154  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  39.57 
 
 
187 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  39.56 
 
 
185 aa  154  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  42.08 
 
 
186 aa  153  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  38.5 
 
 
187 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  44.26 
 
 
185 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  38.8 
 
 
185 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  38.5 
 
 
189 aa  153  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  39.56 
 
 
185 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  40.98 
 
 
186 aa  151  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  37.97 
 
 
187 aa  151  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  38.46 
 
 
185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  41.44 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  38.83 
 
 
187 aa  150  8.999999999999999e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  38.38 
 
 
188 aa  149  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  38.46 
 
 
185 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  39.89 
 
 
186 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  41.76 
 
 
185 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  40.33 
 
 
185 aa  148  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  39.34 
 
 
187 aa  148  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  38.46 
 
 
194 aa  147  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  40.66 
 
 
185 aa  147  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  39.04 
 
 
189 aa  147  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  40.33 
 
 
185 aa  147  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  40.33 
 
 
185 aa  147  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  40.33 
 
 
185 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  40.33 
 
 
185 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  39.04 
 
 
189 aa  147  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>