28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1337 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  785    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  61.54 
 
 		 388 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  60.57 
 
 		 388 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  62.2 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  62.2 
 
 		 388 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  61.93 
 
 		 388 aa  488  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  61.79 
 
 		 388 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  62.13 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  61.79 
 
 		 388 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  60.63 
 
 		 391 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  61.58 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  60.43 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  58.79 
 
 		 389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  51.63 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  47.55 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  45.53 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  29.87 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  28.2 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3107  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 368 aa  149  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  27.59 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  27.43 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3786  hypothetical protein  25.26 
 
 		 398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  26.62 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  24.23 
 
 		 396 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1800  hypothetical protein  25.59 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3158  hypothetical protein  23.3 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0682  hypothetical protein  21.46 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1475  hypothetical protein  23.68 
 
 		 440 aa  43.1  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>