27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1588 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  798    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  80.32 
 
 		 388 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  62.87 
 
 		 386 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  59.79 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  56.42 
 
 		 388 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  56.42 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  56.15 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  54.35 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  54.21 
 
 		 391 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  54.2 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  54.35 
 
 		 388 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  54.89 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  54.35 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  50.89 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  48.45 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  46.79 
 
 		 391 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3107  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 368 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  27.49 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  25.32 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  25.94 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  25.75 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3158  hypothetical protein  23.38 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1800  hypothetical protein  23.26 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3786  hypothetical protein  21.45 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0682  hypothetical protein  36.51 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>