23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0682 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0682  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  636    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  45.71 
 
 
391 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  20.6 
 
 
390 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  41.43 
 
 
388 aa  55.8  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  41.43 
 
 
388 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  41.43 
 
 
388 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  41.43 
 
 
388 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  40 
 
 
404 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  30 
 
 
386 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  35.06 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  23 
 
 
378 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  32.31 
 
 
402 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  34.43 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  35.8 
 
 
388 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  35.8 
 
 
388 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  35.8 
 
 
388 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  35.8 
 
 
393 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  35.38 
 
 
388 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  20.97 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  30.43 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  28.81 
 
 
388 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  21.51 
 
 
377 aa  42.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>