27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2970 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  84.14 
 
 		 391 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  98.71 
 
 		 388 aa  783    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  98.71 
 
 		 393 aa  785    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  796    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  85.82 
 
 		 388 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  98.71 
 
 		 388 aa  784    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  86.34 
 
 		 388 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  86.6 
 
 		 388 aa  677    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  86.6 
 
 		 388 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  61.58 
 
 		 386 aa  481  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  53.58 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  56.92 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  56.28 
 
 		 388 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  54.59 
 
 		 402 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  50.9 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  43.68 
 
 		 391 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  27.45 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3107  putative lipoprotein  28.5 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  25.32 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  24.53 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  25.89 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1800  hypothetical protein  27.13 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  26.08 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3786  hypothetical protein  24.81 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  22.74 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3158  hypothetical protein  22.29 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0682  hypothetical protein  35.8 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>