26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1800 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1800  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  785    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  73.21 
 
 		 377 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  73.33 
 
 		 377 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  58.18 
 
 		 378 aa  467  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  27.82 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  27.59 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  28.08 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  27.56 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  27.56 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  22.83 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3107  putative lipoprotein  25 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  26.91 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  26.91 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  26.91 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  26.91 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  25.88 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  26.32 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  25.92 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  27.11 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  26.79 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  24.5 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  25.59 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3786  hypothetical protein  24.54 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  23.7 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  23.26 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3158  hypothetical protein  22.55 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>