27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2346 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  790    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1800  hypothetical protein  58.18 
 
 
377 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  57.45 
 
 
377 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  56.08 
 
 
377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  27.44 
 
 
389 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  26.58 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  25.8 
 
 
388 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  26.26 
 
 
388 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  26.26 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3107  putative lipoprotein  25.27 
 
 
368 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  25.95 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  26.23 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  24.73 
 
 
388 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  24.86 
 
 
388 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  24.66 
 
 
391 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  26.74 
 
 
386 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  24.86 
 
 
388 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  24.86 
 
 
393 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  25.33 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  25.07 
 
 
396 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  25.47 
 
 
388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3786  hypothetical protein  24.92 
 
 
398 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  25.4 
 
 
388 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  22.61 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  22.56 
 
 
404 aa  96.7  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3158  hypothetical protein  25 
 
 
403 aa  89.7  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0682  hypothetical protein  23 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>