27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2605 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  82.61 
 
 
391 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  86.08 
 
 
388 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  86.34 
 
 
393 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  85.82 
 
 
388 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  790    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  86.08 
 
 
388 aa  675    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  83.25 
 
 
388 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  83.51 
 
 
388 aa  670    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  83.51 
 
 
388 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  60.43 
 
 
386 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  57.38 
 
 
388 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  54.11 
 
 
388 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  56.92 
 
 
389 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  55.38 
 
 
402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  50.52 
 
 
404 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  45.48 
 
 
391 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  28.11 
 
 
390 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3107  putative lipoprotein  25.54 
 
 
368 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  25.77 
 
 
394 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  25.52 
 
 
378 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  26.13 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3786  hypothetical protein  25.06 
 
 
398 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1800  hypothetical protein  26.33 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  24.68 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  23.76 
 
 
396 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3158  hypothetical protein  24.1 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0682  hypothetical protein  41.43 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>