27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1332 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  795    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  63.39 
 
 		 388 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  61.14 
 
 		 388 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  59.89 
 
 		 386 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  57.99 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  58.2 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  58.2 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  58.2 
 
 		 388 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  57.99 
 
 		 388 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  57.72 
 
 		 388 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  58.42 
 
 		 391 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  57.72 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  58.38 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  47.64 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  44.96 
 
 		 404 aa  368  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  42.93 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  31.04 
 
 		 390 aa  192  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  29.01 
 
 		 394 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3107  putative lipoprotein  27.42 
 
 		 368 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  27.44 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  25.56 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  26.19 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1800  hypothetical protein  27.11 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  25.71 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3786  hypothetical protein  24.02 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3158  hypothetical protein  25.6 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0682  hypothetical protein  35.06 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>