27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2326 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  795    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  44.96 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  46.45 
 
 		 388 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  46.47 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  46.2 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  45.92 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  46.88 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  46.79 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  45.21 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  44.26 
 
 		 393 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  44.26 
 
 		 388 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  44.38 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  44.26 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  45.53 
 
 		 386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  42.93 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  42.71 
 
 		 404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  27.42 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3107  putative lipoprotein  26.61 
 
 		 368 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  25.71 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  26.69 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  24.66 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  26.51 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  25.73 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1800  hypothetical protein  26.32 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3786  hypothetical protein  22.65 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3158  hypothetical protein  24.32 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0682  hypothetical protein  34.43 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>