26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01276 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  87.53 
 
 
377 aa  710    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  787    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1800  hypothetical protein  73.21 
 
 
377 aa  596  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  57.45 
 
 
378 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  27.75 
 
 
390 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3107  putative lipoprotein  26.63 
 
 
368 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  26.25 
 
 
394 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  26.11 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  25.86 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  25 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  25.93 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  25.66 
 
 
388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  25.73 
 
 
391 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  24.93 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  26.74 
 
 
386 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  25.13 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  25.71 
 
 
389 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3786  hypothetical protein  23.2 
 
 
398 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  26.77 
 
 
388 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  25.06 
 
 
404 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  25.78 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  24.19 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3158  hypothetical protein  25.13 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>