27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3107 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3107  putative lipoprotein  100 
 
 		 368 aa  758    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02938  putative lipoprotein  36.44 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1468  putative lipoprotein  34.15 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1251  hypothetical protein  28.34 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1313  hypothetical protein  28.07 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1321  hypothetical protein  28.07 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3096  hypothetical protein  27.61 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.726854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3108  hypothetical protein  28.99 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1408  hypothetical protein  28.99 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2955  hypothetical protein  28.72 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2970  hypothetical protein  28.72 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1332  hypothetical protein  27.42 
 
 		 389 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1588  hypothetical protein  26.9 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1153  hypothetical protein  28.46 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3258  hypothetical protein  26.36 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1337  hypothetical protein  28.07 
 
 		 386 aa  149  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1295  hypothetical protein  27.57 
 
 		 404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2605  hypothetical protein  25.96 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2326  hypothetical protein  26.61 
 
 		 391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01276  hypothetical protein  26.63 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2346  hypothetical protein  25.27 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.722326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2813  hypothetical protein  26.02 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.767997  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004181  hypothetical protein  26.63 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3786  hypothetical protein  25.46 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1800  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3158  hypothetical protein  25.29 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2389  hypothetical protein  23.08 
 
 		 326 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>