More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23840  amino acid carrier protein  100 
 
 		 504 aa  1024    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000023715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  61.39 
 
 		 504 aa  632  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00400  amino acid carrier protein  54.45 
 
 		 523 aa  549  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149456  hitchhiker  0.00282795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  53.22 
 
 		 458 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  47.74 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  47.05 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  46.84 
 
 		 479 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  46.84 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  46.84 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  47.41 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  46.64 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  46.84 
 
 		 479 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  47.33 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  46.84 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  45.42 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  46.8 
 
 		 470 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0600  sodium:alanine symporter family protein  45.25 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  47.51 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  44.67 
 
 		 485 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  47.51 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0982  amino acid carrier protein  46.25 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  44.19 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  44.19 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0912  amino acid carrier protein  46.04 
 
 		 488 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.302658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  44.19 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  43.98 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  43.98 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  43.78 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  44.26 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1390  hypothetical protein  48 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.68223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  44.19 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  42.92 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  44.35 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  44.35 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  43.83 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  43.83 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  43.83 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  44.03 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  41.3 
 
 		 484 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  44.3 
 
 		 474 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  44.03 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0830  amino acid carrier protein  46.27 
 
 		 475 aa  396  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0296713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  43.21 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  45.28 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  43.21 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  44.3 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  43.57 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  44.3 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  43.57 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  44.3 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  44.92 
 
 		 543 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  43.83 
 
 		 477 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3671  amino acid carrier protein  42.95 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  45.61 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  44.88 
 
 		 486 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  44.11 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0099  amino acid carrier protein  46.35 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00900834  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  45.05 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  44.88 
 
 		 486 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  45.47 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  44.63 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  45.06 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  45.06 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  45.06 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  45.06 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  45.06 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  45.68 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  43.14 
 
 		 504 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  45.06 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  45.06 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  45.68 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  44.85 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  41.99 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  44.28 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  43.87 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4424  amino acid carrier protein  42.37 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107897  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  41.35 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  43.66 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1200  amino acid carrier protein  42.92 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.294812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  42.89 
 
 		 479 aa  372  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  42.83 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4714  amino acid carrier protein  44.31 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  42.62 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26340  amino acid carrier protein  44.19 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.159841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  43.04 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  41.39 
 
 		 493 aa  360  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24790  amino acid carrier protein  39.27 
 
 		 502 aa  360  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.558216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  41.72 
 
 		 480 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  43.8 
 
 		 476 aa  359  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  42.19 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  41.03 
 
 		 492 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  40 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  42.8 
 
 		 496 aa  349  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  41.27 
 
 		 493 aa  349  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0539  amino acid carrier protein  40.34 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  38.7 
 
 		 483 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1431  amino acid carrier protein  40.32 
 
 		 495 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1496  amino acid carrier protein  40.32 
 
 		 495 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  40.32 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10930  amino acid carrier protein  41.35 
 
 		 490 aa  347  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>