More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1390 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1390  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  978    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.68223  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0600  sodium:alanine symporter family protein  61.52 
 
 
480 aa  590  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0982  amino acid carrier protein  61.86 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0912  amino acid carrier protein  63.28 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.302658  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0830  amino acid carrier protein  63.54 
 
 
475 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0296713  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00400  amino acid carrier protein  48.3 
 
 
523 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149456  hitchhiker  0.00282795 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  48.14 
 
 
504 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  43.24 
 
 
470 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  45.32 
 
 
458 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  46.28 
 
 
466 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  46.58 
 
 
466 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23840  amino acid carrier protein  47.46 
 
 
504 aa  398  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000023715  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  42.71 
 
 
485 aa  395  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  42.21 
 
 
480 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  42.18 
 
 
479 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  42.18 
 
 
479 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  41.98 
 
 
479 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  42.18 
 
 
479 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  42.18 
 
 
479 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  42.21 
 
 
480 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  41.98 
 
 
479 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  42.65 
 
 
480 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  45.84 
 
 
474 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  46.06 
 
 
474 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  41.92 
 
 
481 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  41.98 
 
 
479 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  45.84 
 
 
474 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  46.06 
 
 
474 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  46.06 
 
 
474 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  46.06 
 
 
474 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  44.58 
 
 
486 aa  372  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  44.58 
 
 
486 aa  372  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  41.36 
 
 
476 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  41.24 
 
 
476 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  41.36 
 
 
476 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0099  amino acid carrier protein  44.49 
 
 
468 aa  362  6e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00900834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  40.95 
 
 
476 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  41.15 
 
 
476 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  41.15 
 
 
476 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  42.73 
 
 
479 aa  362  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  39.34 
 
 
543 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  41.18 
 
 
477 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  41.18 
 
 
477 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  39.92 
 
 
484 aa  358  9e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  40.08 
 
 
476 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  40.21 
 
 
476 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  41.79 
 
 
483 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  40.79 
 
 
496 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  40.45 
 
 
478 aa  352  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  40.83 
 
 
483 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  40.97 
 
 
477 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  39.42 
 
 
480 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  40.76 
 
 
477 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  42.68 
 
 
494 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  40.76 
 
 
477 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  41.2 
 
 
483 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3198  amino acid carrier protein  40.04 
 
 
483 aa  350  4e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  40.76 
 
 
477 aa  350  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  40.76 
 
 
477 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  40.37 
 
 
477 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  40.55 
 
 
477 aa  349  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  40.76 
 
 
477 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3671  amino acid carrier protein  39.18 
 
 
480 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  40.54 
 
 
485 aa  347  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  41.23 
 
 
493 aa  346  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  40.66 
 
 
498 aa  345  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  41.01 
 
 
492 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  42.03 
 
 
489 aa  343  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  39.27 
 
 
487 aa  342  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  41.48 
 
 
477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  39.23 
 
 
486 aa  340  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  38.98 
 
 
496 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  41.83 
 
 
471 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  39.23 
 
 
486 aa  339  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  39.52 
 
 
475 aa  339  8e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  38.87 
 
 
487 aa  338  9e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  42.01 
 
 
476 aa  338  9e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  38.87 
 
 
487 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  39.02 
 
 
486 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  39.02 
 
 
486 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  39.26 
 
 
493 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  39.02 
 
 
486 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  39.96 
 
 
486 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  39.59 
 
 
495 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  40.62 
 
 
502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  41.61 
 
 
471 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  42.45 
 
 
488 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  38.98 
 
 
497 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  40.08 
 
 
480 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3063  sodium:alanine symporter family protein  38.68 
 
 
495 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  42.41 
 
 
477 aa  334  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  38.9 
 
 
503 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  38.9 
 
 
503 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  38.9 
 
 
503 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  38.9 
 
 
503 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2881  sodium/alanine symporter family protein  38.98 
 
 
496 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202211  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1496  amino acid carrier protein  38.89 
 
 
495 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  38.9 
 
 
503 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  38.9 
 
 
503 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  38.68 
 
 
494 aa  333  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>