More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0830 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0830  amino acid carrier protein  100 
 
 
475 aa  947    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0296713  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1390  hypothetical protein  63.54 
 
 
486 aa  593  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.68223  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0600  sodium:alanine symporter family protein  61.28 
 
 
480 aa  578  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0982  amino acid carrier protein  62.85 
 
 
488 aa  568  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0912  amino acid carrier protein  62.85 
 
 
488 aa  566  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.302658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  48.22 
 
 
504 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  43.28 
 
 
470 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00400  amino acid carrier protein  43.95 
 
 
523 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149456  hitchhiker  0.00282795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  42 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  42 
 
 
479 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  42.2 
 
 
479 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  42 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  42 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  42.2 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  41.79 
 
 
479 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  41.79 
 
 
480 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  41.79 
 
 
479 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  41.79 
 
 
480 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  45.59 
 
 
458 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  43.38 
 
 
478 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  44.26 
 
 
485 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  41.75 
 
 
476 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  41.82 
 
 
480 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  44.28 
 
 
466 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  44.77 
 
 
466 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  41.54 
 
 
476 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  41.54 
 
 
476 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23840  amino acid carrier protein  46.06 
 
 
504 aa  383  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000023715  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  41.21 
 
 
476 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  41.21 
 
 
476 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  41 
 
 
476 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  41.21 
 
 
476 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  42.98 
 
 
477 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  42.98 
 
 
477 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0099  amino acid carrier protein  44.23 
 
 
468 aa  376  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00900834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  42.65 
 
 
474 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  41.13 
 
 
476 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  42.65 
 
 
474 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  42.23 
 
 
474 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  42.44 
 
 
474 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  42.44 
 
 
474 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  42.44 
 
 
474 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  43.4 
 
 
477 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  42.55 
 
 
477 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  42.98 
 
 
477 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  42.77 
 
 
477 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  42.77 
 
 
477 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  42.55 
 
 
477 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  42.55 
 
 
477 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  42.14 
 
 
477 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  43.56 
 
 
479 aa  363  3e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  43.07 
 
 
494 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  44.35 
 
 
477 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  44.49 
 
 
486 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  44.49 
 
 
486 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  43.92 
 
 
476 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  37.74 
 
 
484 aa  346  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  43.71 
 
 
477 aa  346  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3198  amino acid carrier protein  40.56 
 
 
483 aa  343  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  40.13 
 
 
543 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  40.68 
 
 
503 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  42.42 
 
 
496 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  41.99 
 
 
495 aa  339  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  42.22 
 
 
471 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  42.06 
 
 
504 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  41.85 
 
 
504 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  41.44 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3671  amino acid carrier protein  38.36 
 
 
480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  40.04 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  40.04 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  40.04 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  40.04 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  40.04 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  40.04 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  40.04 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  42 
 
 
471 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  41.91 
 
 
470 aa  334  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0539  amino acid carrier protein  40 
 
 
480 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0551  amino acid carrier protein  40.43 
 
 
480 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0496  amino acid carrier protein  40.22 
 
 
480 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  40.99 
 
 
497 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  38.76 
 
 
483 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0530  amino acid carrier protein  40.22 
 
 
480 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  40.99 
 
 
497 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  40.99 
 
 
497 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  39.88 
 
 
487 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4424  amino acid carrier protein  40.04 
 
 
497 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107897  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5626  Sodium:alanine symporter  40 
 
 
481 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28273  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26340  amino acid carrier protein  40.92 
 
 
485 aa  330  3e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.159841 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2555  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  40.16 
 
 
496 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2590  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  40.37 
 
 
496 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2836  sodium/alanine symporter family protein  40.16 
 
 
496 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278121 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  39.8 
 
 
487 aa  329  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  39.68 
 
 
487 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2881  sodium/alanine symporter family protein  39.96 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2633  amino acid carrier protein  39.96 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  39.35 
 
 
496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  39.26 
 
 
493 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  39.59 
 
 
486 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  39.59 
 
 
486 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>