More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0600 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0982  amino acid carrier protein  72.2 
 
 		 488 aa  670    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0600  sodium:alanine symporter family protein  100 
 
 		 480 aa  966    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0912  amino acid carrier protein  72.2 
 
 		 488 aa  669    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.302658  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1390  hypothetical protein  61.52 
 
 		 486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.68223  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0830  amino acid carrier protein  61.28 
 
 		 475 aa  556  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0296713  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  46.81 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00400  amino acid carrier protein  43.75 
 
 		 523 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149456  hitchhiker  0.00282795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  41.31 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  41.51 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  41.51 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  41.29 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  41.31 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  41.51 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  44.75 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  40.9 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  41.31 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  41.51 
 
 		 480 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23840  amino acid carrier protein  45.25 
 
 		 504 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000023715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  41.1 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  40.08 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  41.31 
 
 		 480 aa  395  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  42.52 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  43.03 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  43.24 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  42.62 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  42.42 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  42.62 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  42.62 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  42.62 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  42.42 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  44.02 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0099  amino acid carrier protein  43.75 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00900834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  42.8 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  42.68 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  42.68 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  42.68 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  42.68 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  45.24 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  42.26 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  42.26 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  45.24 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  40.98 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  38.89 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  39.38 
 
 		 477 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  39.38 
 
 		 477 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  39.59 
 
 		 477 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  39.59 
 
 		 477 aa  359  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  38.97 
 
 		 477 aa  359  7e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  39.38 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  39.59 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  40.84 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  38.74 
 
 		 543 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  39.38 
 
 		 477 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3671  amino acid carrier protein  40 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  41.09 
 
 		 494 aa  349  8e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4424  amino acid carrier protein  39.71 
 
 		 497 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107897  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  41.3 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  39.44 
 
 		 483 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  40 
 
 		 477 aa  339  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  39.22 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  40.12 
 
 		 487 aa  335  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  40.46 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  39.92 
 
 		 487 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26340  amino acid carrier protein  38.43 
 
 		 485 aa  333  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.159841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  37.83 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 		 486 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  37.85 
 
 		 475 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0539  amino acid carrier protein  38.49 
 
 		 480 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  39.71 
 
 		 487 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  39.8 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  39.8 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  39.8 
 
 		 486 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  39.8 
 
 		 486 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0617  amino acid carrier protein  38.11 
 
 		 495 aa  330  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0496  amino acid carrier protein  38.06 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3198  amino acid carrier protein  36.31 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  39.18 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2836  sodium/alanine symporter family protein  37.53 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278121 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2590  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  37.53 
 
 		 496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2555  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  37.53 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0551  amino acid carrier protein  38.38 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0530  amino acid carrier protein  38.16 
 
 		 480 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5626  Sodium:alanine symporter  39.14 
 
 		 481 aa  326  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28273  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24790  amino acid carrier protein  37.66 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.558216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2633  amino acid carrier protein  37.32 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2881  sodium/alanine symporter family protein  37.32 
 
 		 496 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  40.34 
 
 		 470 aa  323  6e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  37.01 
 
 		 498 aa  322  7e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2639  sodium/alanine symporter family protein  37.12 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.658687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2830  sodium/alanine symporter family protein  37.12 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.703902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  38.49 
 
 		 480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19510  amino acid carrier protein  38.68 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  38.95 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  36.68 
 
 		 494 aa  320  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3063  sodium:alanine symporter family protein  36.48 
 
 		 495 aa  319  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  39.16 
 
 		 471 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2859  sodium/alanine symporter family protein  37.32 
 
 		 496 aa  319  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  39.54 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>