More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3671 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3671  amino acid carrier protein  100 
 
 
480 aa  961    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  56.78 
 
 
484 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  56.5 
 
 
543 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4424  amino acid carrier protein  55.03 
 
 
497 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107897  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5513  amino acid carrier protein  53.15 
 
 
488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538617  normal  0.636918 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  47.07 
 
 
480 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  46.67 
 
 
470 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  46.86 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  46.49 
 
 
480 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  46.65 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  46.86 
 
 
479 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  46.39 
 
 
479 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  46.6 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  46.86 
 
 
479 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  47.07 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  46.44 
 
 
479 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  46.39 
 
 
479 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26340  amino acid carrier protein  48.64 
 
 
485 aa  431  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.159841 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  45.74 
 
 
474 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  45.74 
 
 
474 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  45.32 
 
 
474 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  44.61 
 
 
458 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  45.11 
 
 
474 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  45.32 
 
 
474 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  45.32 
 
 
474 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  44.31 
 
 
476 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  44.3 
 
 
476 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  44.09 
 
 
476 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  44.3 
 
 
476 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  44.3 
 
 
476 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  44.3 
 
 
476 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19510  amino acid carrier protein  48.65 
 
 
480 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  44.95 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  43.88 
 
 
476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  44.91 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  43.88 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  45.57 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  45.36 
 
 
466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  44.7 
 
 
477 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  44.7 
 
 
477 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24790  amino acid carrier protein  43.87 
 
 
502 aa  405  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.558216  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  46.55 
 
 
504 aa  402  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  44.28 
 
 
477 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 
477 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 
477 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  43.45 
 
 
477 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 
477 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  44.28 
 
 
477 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  43.45 
 
 
477 aa  395  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  43.42 
 
 
477 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  44.05 
 
 
486 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  44.05 
 
 
486 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  44.54 
 
 
494 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  44.31 
 
 
477 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  45.47 
 
 
503 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  45.47 
 
 
503 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  45.47 
 
 
503 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  45.47 
 
 
503 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  45.47 
 
 
503 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  45.47 
 
 
503 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  45.47 
 
 
503 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  45.21 
 
 
477 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  45.47 
 
 
503 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23840  amino acid carrier protein  42.32 
 
 
504 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000023715  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  46.22 
 
 
497 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00400  amino acid carrier protein  40.76 
 
 
523 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149456  hitchhiker  0.00282795 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  46.01 
 
 
497 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  45.47 
 
 
495 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  46.01 
 
 
497 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11080  amino acid carrier protein  43.11 
 
 
498 aa  365  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0903733  normal  0.126289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1200  amino acid carrier protein  45.03 
 
 
484 aa  364  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.294812  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  44.96 
 
 
504 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  44.96 
 
 
504 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  42.65 
 
 
480 aa  362  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  43.84 
 
 
471 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  43.22 
 
 
471 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  43.85 
 
 
480 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  44.37 
 
 
476 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  42.59 
 
 
496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0600  sodium:alanine symporter family protein  40 
 
 
480 aa  355  1e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  41.39 
 
 
489 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  42.24 
 
 
479 aa  352  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  42.64 
 
 
483 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  44.54 
 
 
498 aa  348  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  40.83 
 
 
483 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1390  hypothetical protein  39.18 
 
 
486 aa  342  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.68223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  40.62 
 
 
483 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4714  amino acid carrier protein  44.23 
 
 
484 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  41.44 
 
 
485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  43.95 
 
 
488 aa  339  7e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0912  amino acid carrier protein  37.85 
 
 
488 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.302658  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0982  amino acid carrier protein  37.63 
 
 
488 aa  336  5e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  42.89 
 
 
493 aa  335  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  41.44 
 
 
502 aa  335  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10930  amino acid carrier protein  43.94 
 
 
490 aa  334  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  41.89 
 
 
502 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  41.94 
 
 
480 aa  333  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  42.06 
 
 
468 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  44.19 
 
 
474 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2933  sodium/alanine symporter family protein, C-terminus  44.47 
 
 
376 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.736541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>