More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10930 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10930  amino acid carrier protein  100 
 
 		 490 aa  961    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1200  amino acid carrier protein  64.85 
 
 		 484 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.294812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4714  amino acid carrier protein  61.59 
 
 		 484 aa  537  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1694  amino acid carrier protein  58.16 
 
 		 493 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.660605  decreased coverage  0.00111847 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  51.02 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  51.02 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  51.02 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  51.02 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  51.02 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  51.02 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  51.02 
 
 		 503 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  50.2 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  49.3 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  49.8 
 
 		 495 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  50.21 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  47.44 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  50.41 
 
 		 504 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  47.49 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  47.58 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  50 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  48.91 
 
 		 498 aa  409  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  49.79 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  49.79 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  44.42 
 
 		 489 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  47.46 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  43.81 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  44.13 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  48.14 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  43.81 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  49.34 
 
 		 502 aa  398  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  46.19 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  43.64 
 
 		 479 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  43.61 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  50 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  43.61 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  43.61 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  47.96 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  46.12 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  48.12 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  43.72 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  46.75 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  43.84 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  43.72 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  43.06 
 
 		 480 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  46.49 
 
 		 468 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  44.79 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  48.91 
 
 		 543 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  43.24 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  47.21 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  40.61 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  41.1 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  40.41 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0483  amino acid carrier family protein  45.34 
 
 		 477 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  41.74 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  40.61 
 
 		 476 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  40.61 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  41.74 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  40.61 
 
 		 476 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  44.83 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  42.42 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  40.41 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  40.61 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  44.12 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0422  amino acid carrier family protein  45.11 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.797168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  42.35 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  42.44 
 
 		 493 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  45.37 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  47.88 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  42.2 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  44.81 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1241  amino acid carrier protein  47.79 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.912525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  44.49 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  44.49 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  41.42 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  41.94 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  41.94 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  45.83 
 
 		 492 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  41.94 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  41.74 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  41.53 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  44.78 
 
 		 504 aa  364  2e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  44.27 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  41.34 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4424  amino acid carrier protein  45.58 
 
 		 497 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107897  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3541  sodium:alanine symporter family protein  45.03 
 
 		 488 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  41.53 
 
 		 477 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1052  amino acid carrier protein  44.37 
 
 		 481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  41.53 
 
 		 477 aa  362  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5996  amino acid carrier protein  45.93 
 
 		 472 aa  362  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188928 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6060  amino acid carrier protein  45.93 
 
 		 472 aa  362  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  43.95 
 
 		 485 aa  361  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2964  amino acid carrier protein  44.81 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.302472  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3144  amino acid carrier protein  44.81 
 
 		 488 aa  360  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0262714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  41.84 
 
 		 480 aa  359  5e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1148  amino acid carrier protein  44.37 
 
 		 480 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209129  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24790  amino acid carrier protein  42.77 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.558216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>