122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13340  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2474  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 369 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  26.74 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  29.03 
 
 		 1014 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 1000 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.06 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.13 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  23.44 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 1005 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 1002 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  28.05 
 
 		 323 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  25 
 
 		 355 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  27.11 
 
 		 323 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  24.21 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.2 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 298 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  26.29 
 
 		 322 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  24.1 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  23.9 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 350 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  30.86 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  26.95 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.74 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  27.27 
 
 		 324 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  24.24 
 
 		 325 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  23.96 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  24.71 
 
 		 348 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 295 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  25 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 274 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  30.09 
 
 		 387 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  21.76 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  29.01 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  29.51 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  28.98 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  25.27 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.7 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  28.12 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.11 
 
 		 272 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  24.4 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  30.7 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  24.73 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  29.01 
 
 		 330 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 275 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  29.01 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  24.22 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.58 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000587821  hitchhiker  0.0091617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  26.55 
 
 		 332 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2548  methyltransferase, putative  26.83 
 
 		 333 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  25.97 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  28.12 
 
 		 330 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  26.98 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  26.98 
 
 		 332 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  26.98 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  26.98 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.6 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  26.98 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  28.96 
 
 		 411 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3663  methyltransferase type 12  23.94 
 
 		 586 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  27.5 
 
 		 328 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  27.71 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.6 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  25.62 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0078  methyltransferase, putative  25.57 
 
 		 332 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0228138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.39 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  27.18 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  24.72 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  26.83 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  25 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  27.43 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  25.69 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  28.9 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>