More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1930 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1930  threonine synthase  100 
 
 
501 aa  1030    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00162795  normal  0.011056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2746  threonine synthase  60.28 
 
 
501 aa  587  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1945  threonine synthase  58.64 
 
 
492 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0105  threonine synthase  57.32 
 
 
481 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0171  L-threonine synthase  56.91 
 
 
484 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3375  threonine synthase  56.26 
 
 
482 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0177  threonine synthase  60.73 
 
 
482 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1099  threonine synthase  56.79 
 
 
485 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.113278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0435  threonine synthase  34.55 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  33.09 
 
 
404 aa  195  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  32.71 
 
 
404 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1836  threonine synthase  33.92 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  32.11 
 
 
404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  32.04 
 
 
404 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37018  predicted protein  32.05 
 
 
497 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00212861  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  32.25 
 
 
403 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  33.41 
 
 
391 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2124  threonine synthase  33.97 
 
 
452 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2214  threonine synthase  33.73 
 
 
452 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2078  threonine synthase  34.23 
 
 
452 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818493  normal  0.0807622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  31.48 
 
 
405 aa  176  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  31.53 
 
 
432 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.66 
 
 
402 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1723  L-threonine synthase  33.97 
 
 
452 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  32.52 
 
 
419 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  37.32 
 
 
354 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  32.52 
 
 
422 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  32.69 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  32.61 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  33.17 
 
 
401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2963  threonine synthase  30.96 
 
 
483 aa  163  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  32.11 
 
 
394 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  31.63 
 
 
427 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  35.61 
 
 
352 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  36.44 
 
 
352 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  35.98 
 
 
352 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  34.94 
 
 
351 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  34.85 
 
 
351 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  35.23 
 
 
351 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  32.69 
 
 
401 aa  155  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  31.32 
 
 
403 aa  154  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09880  L-threonine synthase  34.75 
 
 
355 aa  154  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.704092  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1745  L-threonine synthase  35.12 
 
 
365 aa  153  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0188218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  32.11 
 
 
459 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  31.72 
 
 
423 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  32.72 
 
 
406 aa  151  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  34.76 
 
 
360 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  35.44 
 
 
359 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  31.71 
 
 
346 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  35.26 
 
 
370 aa  150  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  34.63 
 
 
348 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  29.68 
 
 
408 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  30.41 
 
 
399 aa  149  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  35.35 
 
 
359 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  34.19 
 
 
348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  31.84 
 
 
354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  35.82 
 
 
348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  35.14 
 
 
348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  34.72 
 
 
351 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  35.07 
 
 
374 aa  146  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29950  threonine synthase  34.27 
 
 
364 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  34.51 
 
 
349 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  34.23 
 
 
356 aa  146  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3650  threonine synthase  33.97 
 
 
349 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  36.52 
 
 
377 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  33.84 
 
 
349 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  35.03 
 
 
356 aa  143  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  34.47 
 
 
360 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  34.47 
 
 
360 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  33.92 
 
 
368 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  34.47 
 
 
360 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  34.95 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  34.14 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2622  threonine synthase  33.8 
 
 
368 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2355  threonine synthase  33.8 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000649768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  34.47 
 
 
360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  32.82 
 
 
353 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  32.82 
 
 
353 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0631  threonine synthase  34.93 
 
 
365 aa  140  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  hitchhiker  0.00263749 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  32.73 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  31.99 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  32.71 
 
 
361 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  35.09 
 
 
366 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  34.81 
 
 
347 aa  138  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  33.16 
 
 
371 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  35.58 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  33.54 
 
 
354 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  35.35 
 
 
339 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19330  L-threonine synthase  34.23 
 
 
352 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1789  threonine synthase  35.22 
 
 
356 aa  137  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  32.72 
 
 
331 aa  136  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  34.04 
 
 
352 aa  136  9e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1056  threonine synthase  35.78 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0358634  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  38.6 
 
 
353 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08030  threonine synthase  32.51 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  38.4 
 
 
363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  33.33 
 
 
358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  35.2 
 
 
367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  36.04 
 
 
367 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  37.04 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>