More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0177 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1099  threonine synthase  69.31 
 
 		 485 aa  661    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.113278 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1945  threonine synthase  80.5 
 
 		 492 aa  796    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0171  L-threonine synthase  78.29 
 
 		 484 aa  773    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3375  threonine synthase  71.55 
 
 		 482 aa  692    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0177  threonine synthase  100 
 
 		 482 aa  1002    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0105  threonine synthase  75.11 
 
 		 481 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2746  threonine synthase  59.62 
 
 		 501 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1930  threonine synthase  60.73 
 
 		 501 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00162795  normal  0.011056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2078  threonine synthase  37.77 
 
 		 452 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818493  normal  0.0807622 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2214  threonine synthase  36.1 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2124  threonine synthase  35.99 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0435  threonine synthase  36.26 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1836  threonine synthase  36.01 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  34.07 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  32.51 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  32.1 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  31.6 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  31.6 
 
 		 404 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1723  L-threonine synthase  35.99 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37018  predicted protein  33.17 
 
 		 497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00212861  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  30.62 
 
 		 404 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  32.85 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  35.29 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  34.22 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  32.07 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  33.74 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  35.84 
 
 		 354 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  34.38 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  32.19 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  30.49 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  35.84 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  35.71 
 
 		 354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  34.87 
 
 		 351 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  33.81 
 
 		 348 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  33.82 
 
 		 351 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  36.6 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29950  threonine synthase  35.84 
 
 		 364 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3650  threonine synthase  36.02 
 
 		 349 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  33.24 
 
 		 368 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  35.71 
 
 		 352 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  33.15 
 
 		 356 aa  163  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  35.56 
 
 		 377 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  37.73 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  32.85 
 
 		 351 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  32.12 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  35.16 
 
 		 349 aa  161  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  34.57 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  33.24 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  35.82 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19330  L-threonine synthase  36.02 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  35.54 
 
 		 363 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  30.49 
 
 		 422 aa  160  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  33.24 
 
 		 348 aa  160  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  34.17 
 
 		 367 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  36.86 
 
 		 346 aa  160  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  33.6 
 
 		 371 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  34.86 
 
 		 352 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  36.31 
 
 		 363 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  34.45 
 
 		 367 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  35.82 
 
 		 352 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  36.36 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  36.36 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  35.45 
 
 		 356 aa  158  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08030  threonine synthase  35.64 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  36.02 
 
 		 351 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  34.17 
 
 		 367 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  35.26 
 
 		 361 aa  157  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0631  threonine synthase  35.92 
 
 		 365 aa  156  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  hitchhiker  0.00263749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  29.5 
 
 		 408 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  34.37 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  35.61 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  36.11 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  36.54 
 
 		 356 aa  155  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09880  L-threonine synthase  35.26 
 
 		 355 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.704092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  31.22 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  30.34 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  30.58 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  35.55 
 
 		 359 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  33.04 
 
 		 357 aa  153  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2622  threonine synthase  35.18 
 
 		 368 aa  153  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  31.43 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  32.98 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  35.73 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  35.73 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  33.72 
 
 		 349 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  39.33 
 
 		 339 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  34.71 
 
 		 363 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  35.14 
 
 		 374 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  35.26 
 
 		 359 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  30.57 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  34.57 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  34.29 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  34.57 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  30.57 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  34.57 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  34.46 
 
 		 362 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  33.33 
 
 		 346 aa  150  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  32.95 
 
 		 352 aa  150  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2963  threonine synthase  28.72 
 
 		 483 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  36.49 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>