More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0105 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0105  threonine synthase  100 
 
 		 481 aa  998    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0171  L-threonine synthase  74.32 
 
 		 484 aa  719    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3375  threonine synthase  67.02 
 
 		 482 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1099  threonine synthase  67.36 
 
 		 485 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.113278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0177  threonine synthase  75.11 
 
 		 482 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1945  threonine synthase  74.95 
 
 		 492 aa  724    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1930  threonine synthase  57.32 
 
 		 501 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00162795  normal  0.011056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2746  threonine synthase  56.73 
 
 		 501 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2078  threonine synthase  38.05 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818493  normal  0.0807622 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2124  threonine synthase  36.28 
 
 		 452 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2214  threonine synthase  36.32 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1836  threonine synthase  36.01 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0435  threonine synthase  35.36 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  33 
 
 		 404 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  33 
 
 		 404 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  33 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  32.92 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1723  L-threonine synthase  36.08 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  32.01 
 
 		 404 aa  187  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  32.68 
 
 		 405 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37018  predicted protein  32.28 
 
 		 497 aa  180  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00212861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  32.23 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  33.01 
 
 		 432 aa  176  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  33.5 
 
 		 401 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  33.41 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  32.77 
 
 		 399 aa  169  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  33.33 
 
 		 401 aa  169  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  32.11 
 
 		 391 aa  169  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  31.86 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  32.03 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  33.09 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  33.62 
 
 		 354 aa  168  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  33.17 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  35.06 
 
 		 352 aa  163  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  35.51 
 
 		 354 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  34 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  35.63 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  36.1 
 
 		 352 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  32.52 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  36.07 
 
 		 348 aa  158  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09880  L-threonine synthase  36.13 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.704092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  34.96 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  32.75 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  35.26 
 
 		 377 aa  156  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  31.65 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  34.77 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  32.75 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  31.54 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29950  threonine synthase  34.2 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  34.29 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  35.84 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  34.86 
 
 		 374 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  35.41 
 
 		 348 aa  153  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  32.31 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  36.42 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  35.04 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  35.74 
 
 		 348 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  34.77 
 
 		 351 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2963  threonine synthase  28.89 
 
 		 483 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  35.65 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0631  threonine synthase  35.04 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  hitchhiker  0.00263749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3650  threonine synthase  34.39 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  35.84 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  34.08 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  34.78 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  36.91 
 
 		 363 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  34.68 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  35.26 
 
 		 349 aa  147  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  34.04 
 
 		 403 aa  146  9e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  35.07 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  34.08 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  30.92 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  31.52 
 
 		 356 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  30.77 
 
 		 346 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08030  threonine synthase  32.78 
 
 		 370 aa  144  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  34.98 
 
 		 367 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1745  L-threonine synthase  35.84 
 
 		 365 aa  143  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0188218  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  30.55 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  32.95 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  35.38 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  30.55 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  35.37 
 
 		 368 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  32.27 
 
 		 357 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  33.05 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2622  threonine synthase  34.27 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  35.37 
 
 		 368 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  36.59 
 
 		 366 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  34.29 
 
 		 371 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  34.78 
 
 		 367 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  33.73 
 
 		 367 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  36.57 
 
 		 356 aa  140  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  34.66 
 
 		 377 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2355  threonine synthase  33.71 
 
 		 368 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000649768 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  36.65 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  32.63 
 
 		 360 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  34.4 
 
 		 345 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19330  L-threonine synthase  33.24 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1789  threonine synthase  36.13 
 
 		 356 aa  138  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1056  threonine synthase  35.45 
 
 		 363 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0358634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  33.44 
 
 		 377 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>