More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1650 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1650  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 1195 aa  2410    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710672 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  36.94 
 
 		 801 aa  325  3e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 681 aa  324  8e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  37.12 
 
 		 803 aa  322  3e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 770 aa  322  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 954 aa  319  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 729 aa  318  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  40.95 
 
 		 1089 aa  318  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  38.14 
 
 		 774 aa  317  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 		 701 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  41.05 
 
 		 720 aa  316  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 1031 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 558 aa  315  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 598 aa  312  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 696 aa  312  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 747 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  39.66 
 
 		 685 aa  311  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  38.08 
 
 		 785 aa  310  6.999999999999999e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  38.2 
 
 		 783 aa  310  8e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 1030 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 745 aa  309  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  35.31 
 
 		 769 aa  308  3e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  36.51 
 
 		 769 aa  307  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  37.02 
 
 		 769 aa  306  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  37.74 
 
 		 770 aa  306  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 715 aa  306  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 673 aa  306  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 802 aa  306  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 695 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 741 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 603 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  39.21 
 
 		 610 aa  304  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 694 aa  304  6.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 746 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  36.18 
 
 		 714 aa  303  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 606 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 607 aa  303  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 604 aa  303  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 747 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 759 aa  303  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 673 aa  303  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 738 aa  303  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  39.16 
 
 		 760 aa  303  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  34.69 
 
 		 751 aa  303  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.19 
 
 		 770 aa  302  2e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  41.03 
 
 		 625 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  39.66 
 
 		 758 aa  301  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  36.97 
 
 		 601 aa  300  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 671 aa  300  8e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  38.92 
 
 		 762 aa  300  9e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 671 aa  300  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 957 aa  300  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 746 aa  300  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  41.03 
 
 		 639 aa  300  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  38.92 
 
 		 762 aa  300  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  37.87 
 
 		 674 aa  300  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 687 aa  300  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 741 aa  299  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 695 aa  299  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.84 
 
 		 767 aa  300  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 660 aa  299  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.98 
 
 		 806 aa  298  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 671 aa  299  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 733 aa  298  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 686 aa  298  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  39.75 
 
 		 719 aa  298  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 691 aa  297  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  39.02 
 
 		 928 aa  296  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  38.9 
 
 		 709 aa  296  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  37.68 
 
 		 754 aa  296  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.69 
 
 		 677 aa  296  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 674 aa  295  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 655 aa  295  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 919 aa  295  4e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  36.74 
 
 		 736 aa  295  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 688 aa  294  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 733 aa  294  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 920 aa  294  7e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 677 aa  294  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  38.71 
 
 		 748 aa  294  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.71 
 
 		 758 aa  294  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  36.23 
 
 		 681 aa  293  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  39.32 
 
 		 785 aa  293  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 919 aa  293  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  38.83 
 
 		 744 aa  292  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 666 aa  292  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 719 aa  293  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  39.21 
 
 		 748 aa  293  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1771  CheA signal transduction histidine kinases  38.29 
 
 		 727 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.42 
 
 		 691 aa  292  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.46 
 
 		 754 aa  292  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  36.77 
 
 		 702 aa  292  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  38.59 
 
 		 744 aa  292  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  39.21 
 
 		 753 aa  292  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 654 aa  291  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 725 aa  291  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 878 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  39.26 
 
 		 729 aa  291  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 766 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.37 
 
 		 784 aa  291  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>