140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1512 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1512  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0301  redoxin domain-containing protein  33.51 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2549  redoxin domain-containing protein  39.37 
 
 		 149 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0306  hypothetical protein  33.96 
 
 		 213 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0517  Redoxin domain protein  32.68 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2260  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.66 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000016305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1803  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.03 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0977  Redoxin domain protein  29.3 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1220  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.35 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.45 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0713  hypothetical protein  32.23 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.86 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.86 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  31.18 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  23.89 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  25.47 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  24.65 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  24.65 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  25.47 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  29.63 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  27.05 
 
 		 173 aa  51.6  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.9 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1288  thiol:disulfide interchange protein CycY  27.36 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.36 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  29.41 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  22.32 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  30 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.38 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  23.24 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  25.67 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  28.72 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  24.24 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  25.81 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  22.81 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  24.68 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  25 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3227  redoxin family protein  31.03 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  22.88 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  24.21 
 
 		 447 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  26.03 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  27.91 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  27.91 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  27.91 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  24.55 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.48 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  25.6 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.68 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  29.58 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  22.49 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.26 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  26.04 
 
 		 437 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  26.19 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  28.78 
 
 		 498 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  21.77 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.38 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  23.78 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  26.19 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  25.49 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.53 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  25.17 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  24.26 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3254  Redoxin domain protein  30.85 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0648017  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  24.66 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  25.17 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  25.17 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  25.47 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  24.26 
 
 		 173 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  42.86 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  28.04 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0500  thiredoxin  23.73 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1839  cytochrome C biogenesis protein  24.36 
 
 		 162 aa  44.7  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0573703  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.95 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.19 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  26.19 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  25.44 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  25 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  22.58 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0510  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.25 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0330837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  21.88 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  29.03 
 
 		 403 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  29.03 
 
 		 403 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  22.92 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  23.96 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.24 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.78 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0444  Redoxin domain protein  28 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.567513  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  23.61 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  24.53 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  30.26 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1325  Redoxin domain protein  22.7 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.855613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3124  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.78 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3574  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  29.63 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1400  Redoxin domain protein  27.27 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  21.01 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.68 
 
 		 376 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  21.01 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  21.01 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>