88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0510 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0510  putative lipoprotein  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  63.91 
 
 		 169 aa  231  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0525  redoxin domain-containing protein  65.79 
 
 		 187 aa  214  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2140  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1325  Redoxin domain protein  28.68 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.855613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  29.33 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.97 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  22.15 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  22.15 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.97 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  22.15 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  22.15 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0836  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.69 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  unclonable  0.000000000312074 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  29.47 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  21.52 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  21.52 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.39 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.32 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3386  Redoxin domain protein  28.57 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.49355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.78 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  20.89 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1839  cytochrome C biogenesis protein  19.84 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0573703  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.35 
 
 		 403 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  26.95 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.93 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  27.56 
 
 		 403 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.49 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  20.25 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1212  conserved hypothetical lipoprotein  20.44 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.76 
 
 		 200 aa  48.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4758  redoxin domain-containing protein  19.7 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1180  Peroxiredoxin  23.88 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.55 
 
 		 191 aa  47.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.98 
 
 		 200 aa  47.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  18.94 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  21.74 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1803  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.77 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.16 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.77 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2557  putative heme-binding protein  26.27 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  24.8 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  23.97 
 
 		 270 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1893  bacterioferritin comigratory protein  27.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.75 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1512  redoxin domain-containing protein  27.97 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  26.73 
 
 		 437 aa  44.7  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  23.97 
 
 		 279 aa  44.7  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  30.71 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  27.66 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  22.76 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  23.33 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.66 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0408  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.3 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1602  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  25 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  23.57 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0301  redoxin domain-containing protein  28.24 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3859  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.92 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2142  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.46 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.847657  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  19.83 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  18.99 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0500  thiredoxin  25.74 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2260  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.89 
 
 		 193 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000016305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  21.52 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  25 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  29.36 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  23.78 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  22.76 
 
 		 174 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.71 
 
 		 280 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3124  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.29 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  25.41 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  23.26 
 
 		 213 aa  41.2  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  29.7 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4120  redoxin domain-containing protein  25.77 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585528  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  27 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  25 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1396  thiredoxin  30.88 
 
 		 196 aa  41.2  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  25.66 
 
 		 195 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2549  redoxin domain-containing protein  26.53 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  19.44 
 
 		 182 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 		 199 aa  40.8  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3418  thioredoxin-like protein  24.07 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.53 
 
 		 180 aa  40.8  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3717  redoxin domain-containing protein  21.01 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.050319  normal  0.718647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3644  redoxin  21.01 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3657  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.01 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.517084  normal  0.0138623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>